RNA–Protein interactions for RNA: YOR229W

WTM2, Transcript of Transcriptional modulator, yeast

Gene WTM2, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WTM2	YOR229W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SPR1	P32603	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ATO2	P32907	282 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YPT7	P32939	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MCH2	P36032	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YBR139W	P38109	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	STB5	P38699	743 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CTF8	P38877	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	BUR6	P40096	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ELO3	P40319	345 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	HXT14	P42833	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YHC3	P47040	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ECM27	P47144	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	DIA3	P52290	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YML122C	Q03207	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TMN2	Q04562	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	STP3	Q05937	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MHR1	Q06630	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YAP7	Q08182	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	GRE1	Q08969	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TAF10	Q12030	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	APC9	Q12107	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ATG31	Q12421	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CBP1	P07252	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	GPA2	P10823	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PCT1	P13259	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	STE18	P18852	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	VPS33	P20795	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	LAC1	P28496	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PET127	P32606	800 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PDR3	P33200	976 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CLG1	P35190	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MRPL4	P36517	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SCO2	P38072	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YHR033W	P38690	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
WTM2	YOR229W	SRP14	P38985	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	END3	P39013	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YKE4	P40544	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	IDS2	P46958	469 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YJL163C	P46996	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SBH2	P52871	88 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YGL185C	P53100	379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	BUD17	P53727	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SKO1	Q02100	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	MFM1	Q02783	413 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ATG21	Q02887	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	APC4	Q04601	652 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SMA2	Q04658	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ASM4	Q05166	528 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	CDC123	Q05791	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	STE23	Q06010	1027 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	RAX1	Q08760	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	DAP1	Q12091	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	NSL1	Q12143	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	SWM1	Q12379	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WTM2	YOR229W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	TAF2	P23255	1407 aa		4.84	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	REV3	P14284	1504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MET2	P08465	486 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MAS2	P11914	482 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PEP5	P12868	1029 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	CLN3	P13365	580 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	IFM1	P25038	676 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	RML2	P32611	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	FMP23	P38231	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	PFF1	P38244	976 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	YJL206C	P39529	758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	POG1	P40473	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WTM2	YOR229W	ZAP1	P47043	880 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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