RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	AIM6	Q07716	390 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TRM8	Q12009	286 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ICL2	Q12031	575 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COX17	Q12287	69 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MHF1	Q3E835	90 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	HAP2	P06774	265 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	OCA4	P25366	362 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CTS1	P29029	562 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	NTG1	P31378	399 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CDC5	P32562	705 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	CSE2	P33308	149 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	DRE2	P36152	348 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	APL3	P38065	1025 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ECM13	P38195	257 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ARP1	P38696	384 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	RGI2	P40188	164 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MEP1	P40260	492 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	GAB1	P41733	394 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PTR3	P43606	678 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	EFM3	P47163	339 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	COS12	P53053	380 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YGR151C	P53287	111 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MGR3	Q04472	501 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	APC4	Q04601	652 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	PEX10	Q05568	337 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MFG1	Q07684	458 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	YLR040C	Q07988	224 aa		5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.4	□□□□□ -1.54	not detected
PSH1	YOL054W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
PSH1	YOL054W	ARG81	P05085	880 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	STB6	P36085	766 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ARN2	P38724	620 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	EFM1	P38732	585 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	LNP1	P38878	278 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ERV46	P39727	415 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YEL068C	P39977	110 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YEL020C	P39994	560 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	DDI1	P40087	428 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	AIM23	P47015	356 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RRN5	Q02983	363 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PLP1	Q04004	230 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MCP2	Q06567	569 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MDM36	Q06820	579 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ESC8	Q08119	714 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	THP1	Q08231	455 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RPN6	Q12377	434 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YLR302C	O13544	120 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GAL3	P13045	520 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	STF2	P16965	84 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	DAP2	P18962	818 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GIT1	P25346	518 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RHB1	P25378	209 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ACH1	P32316	526 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	HMT1	P38074	348 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	LDB7	P38210	180 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	VMA22	P38784	181 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	NDE1	P40215	560 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	ALG8	P40351	577 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	HOC1	P47124	396 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	TOM22	P49334	152 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SMA1	Q02651	245 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	IRC15	Q02733	499 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	NEJ1	Q06148	342 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	VTA1	Q06263	330 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YLL007C	Q07799	665 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YPL191C	Q08930	360 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	GRR1	P24814	1151 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	DCC1	P25559	380 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	PTC6	P25646	442 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MEI5	P32489	222 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	CLG1	P35190	452 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SLX1	P38324	304 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	SER33	P40510	469 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	MSE1	P48525	536 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PSH1	YOL054W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55

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