RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	TRR2	P38816	342 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	ROM1	P53046	1155 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	MON1	P53129	644 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	SLD3	P53135	668 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YGR168C	P53293	376 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	RNH202	Q05635	350 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	NFI1	Q12216	726 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YLR126C	Q12288	251 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	TAF14	P35189	244 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	GIP2	P40036	548 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	NUP57	P48837	541 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	MTQ1	P53944	314 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	TLG1	Q03322	224 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	RSN1	Q03516	953 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	SMP3	Q04174	516 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	SMA2	Q04658	369 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YDR061W	Q12298	539 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	MED11	Q99278	115 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	TFS1	P14306	219 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YOR062C	P36025	268 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YKR015C	P36111	568 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	BET3	P36149	193 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YIL086C	P40503	102 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YSA1	Q01976	231 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YDR179W-A	Q03983	463 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	NAT4	Q04751	285 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDR2	YOL052C-A	YOL163W	P0CF20	169 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	VPS51	P36116	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	VPS36	Q06696	566 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YOR365C	Q08844	703 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	CTF8	P38877	133 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	IES5	P40060	125 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	AVT6	P40074	448 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	NRM1	P53718	249 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YOR214C	Q12282	236 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	TRM10	Q12400	293 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	MOD5	P07884	428 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YCR006C	P25350	157 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	KAP122	P32767	1081 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	PTR2	P32901	601 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RPS27B	P38711	82 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	IPT1	P38954	527 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	FMP52	P40008	231 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	APS3	P47064	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	SNF12	P53628	566 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	CAN1	P04817	590 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	DCG1	P32460	244 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	HIR2	P32480	875 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	TOD6	P34219	525 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	FES1	P38260	290 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	IFA38	P38286	347 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	APE4	P38821	490 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	TAT2	P38967	592 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	SOK1	P40317	901 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	ICE2	P40499	491 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	SWP82	P43554	623 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	TRM9	P49957	279 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YMD8	Q03697	442 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YOL036W	Q08206	761 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	GAL4	P04386	881 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	PBN1	P25580	416 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	ECM4	P36156	370 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	VPS52	P39904	641 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	KRE29	P40026	464 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YIL152W	P40455	235 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	CHA4	P43634	648 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	MAL11	P53048	616 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	YGR266W	P53326	701 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	MEP3	P53390	489 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DDR2	YOL052C-A	ABZ2	Q03266	374 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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