RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PRB1	P09232	635 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MAS1	P10507	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MAK32	P23060	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	GID7	P25569	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	MSN4	P33749	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	TVP23	P38962	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	DSN1	P40568	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SAD1	P43589	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	LIF1	P53150	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	INP2	Q03824	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	GIS1	Q03833	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RBD2	Q12270	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RNH203	Q12338	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	OPI3	P05375	206 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	CDC21	P06785	304 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	BAR1	P12630	587 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	DOA4	P32571	926 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	KKQ8	P36004	724 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PEX32	P38292	413 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YPS6	P40583	537 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	PMT5	P52867	743 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YNL146W	P53906	100 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	SHR3	Q02774	210 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ATC1	Q04005	294 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	HSP31	Q04432	237 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ECM7	Q06200	448 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	IMA2	Q08295	589 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	RMD5	Q12508	421 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATR1	YML116W	ARG80	P07249	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YPS1	P32329	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YMC1	P32331	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	FRE1	P32791	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	BUD2	P33314	1104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RSM25	P40496	264 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	HXT9	P40885	567 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PAC11	P40960	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SPG5	P42933	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TOS3	P43637	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YJL043W	P47053	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RAD17	P48581	401 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	AZR1	P50080	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	UBP8	P50102	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	AIM33	Q04516	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	CSM3	Q04659	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PDR8	Q06149	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ARR1	Q06596	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	MCH4	Q08268	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RKM5	Q12367	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	FMP16	Q12497	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SUC2	P00724	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PEP5	P12868	1029 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	MRPL25	P23369	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YEL020C	P39994	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ATM1	P40416	690 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TRS85	P46944	698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YJR154W	P47181	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	VOA1	P53262	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	TIP41	Q12199	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RSR1	P13856	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	MSS51	P32335	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
ATR1	YML116W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	BOP2	Q06150	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	RDR1	Q08904	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATR1	YML116W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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