RNA–Protein interactions for RNA: YML058W-A

HUG1, Transcript of Protein involved in the Mec1p-mediated checkpoint pathway, yeast

Gene HUG1, Length 207 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HUG1	YML058W-A	IME4	P41833	600 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.92	□□□□□ -2.26	not detected
HUG1	YML058W-A	TCB2	P48231	1178 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	RFX1	P48743	811 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	AVT4	P50944	713 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SHE4	P51534	789 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SAP4	P53036	818 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	RSM27	P53305	110 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SNF12	P53628	566 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	ABZ2	Q03266	374 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	RSN1	Q03516	953 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	GMC1	Q04399	608 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	MSC3	Q05812	728 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SEI1	Q06058	285 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	LDB18	Q07887	179 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	GPM3	Q12326	303 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	ERP4	Q12450	207 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	CBS1	P14066	229 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	MET8	P15807	274 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	PET123	P17558	318 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	ARG1	P22768	420 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	MRPL9	P31334	269 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YPT7	P32939	208 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	BET3	P36149	193 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	FMP23	P38231	175 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YBR138C	P38277	524 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YHR035W	P38769	630 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	PHO90	P39535	881 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YER189W	P40104	122 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SHR5	P41912	237 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	IRC5	P43610	853 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	KEL2	P50090	882 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YIP5	P53108	310 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	HOP2	P53187	214 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	COG6	P53959	839 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YLR460C	P54007	376 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.91	□□□□□ -2.26	not detected
HUG1	YML058W-A	YPL107W	Q02873	248 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	ATP25	Q03153	612 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YLR297W	Q05899	129 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	DCR2	Q05924	578 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	NDL1	Q06568	189 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	VAC14	Q06708	880 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	USV1	Q12132	391 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YDL180W	Q12301	547 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YOR012W	Q12351	137 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	EMP46	Q12396	444 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SPE4	Q12455	300 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SKS1	Q12505	502 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	SET6	Q12529	373 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HUG1	YML058W-A	COR1	P07256	457 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	CLN1	P20437	546 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	SAN1	P22470	610 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	NGG1	P32494	702 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	PEX5	P35056	612 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	HOT13	P36078	116 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	REV7	P38927	245 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	MET30	P39014	640 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	ERP2	P39704	215 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	TMN3	P40071	706 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	MOB2	P43563	287 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	SIP18	P50263	79 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	MRPL19	P53875	158 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	AAT1	Q01802	451 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	RIF2	Q06208	395 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	CTS2	Q06350	511 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	MCM21	Q06675	368 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	YLL007C	Q07799	665 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	GAT3	Q07928	141 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	CRT10	Q08226	957 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	FRE3	Q08905	711 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	MED1	Q12321	566 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	VPS5	Q92331	675 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HUG1	YML058W-A	PDX1	P16451	410 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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