RNA–Protein interactions for RNA: YKL169C

YKL169C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL169C, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL169CYKL169C YIP1P53039 248 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C PCP1P53259 346 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C YIF1P53845 314 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C PGA2P53903 129 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C SNZ1Q03148 297 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C URH1Q04179 340 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C ORT1Q12375 292 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C AHC1Q12433 566 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C RMD5Q12508 421 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C CSR2Q12734 1121 aa4.67□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C CDC21P06785 304 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C MAS1P10507 462 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C THR4P16120 514 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data4.66□□□□□ -1.66not detected
YKL169CYKL169C YCR041WP37265 110 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C SPP381P38282 291 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C YHR045WP38775 560 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C ISC1P40015 477 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C BNA6P43619 295 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C GPI15P53961 229 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C STD1Q02794 444 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C PNG1Q02890 363 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C GIP3Q03016 1276 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C APC4Q04601 652 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C RTN1Q04947 295 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C MRPL35Q06678 367 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C PEX27Q08580 376 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C SRL1Q08673 210 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C FMP16Q12497 93 aa4.66□□□□□ -1.66
YKL169CYKL169C KSS1P14681 368 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C HXT2P23585 541 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C HSP104P31539 908 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C PRO3P32263 286 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data4.65□□□□□ -1.67not detected
YKL169CYKL169C FRE2P36033 711 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YKR015CP36111 568 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C SLX1P38324 304 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C STP2P38704 541 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C RRP3P38712 501 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ALP1P38971 573 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C MET30P39014 640 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C PCF11P39081 626 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C RRT5P43607 289 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C TOS3P43637 560 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C URC2Q04411 772 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C FMP42Q04991 504 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C GPN3Q06543 272 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C SNA4Q07549 140 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C NSE1Q07913 336 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C SKI7Q08491 747 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C SPO24Q3E752 67 aa4.65□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C NFT1P0CE68 1218 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YCR100CP25606 316 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C RME1P32338 300 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YNK1P36010 153 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YER085CP40058 173 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C IKS1P47042 667 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C TIM21P53220 239 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YPL068CQ02749 293 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ODC1Q03028 310 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C GTO3Q04806 366 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ATG34Q12292 412 aa4.64□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ARG4P04076 463 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C IMA3P0CW40 589 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C IMA4P0CW41 589 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C RNA14P25298 677 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YPS1P32329 569 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ARO4P32449 370 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C MEI5P32489 222 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YSC83P32792 385 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C BUD2P33314 1104 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C RIM2P38127 377 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C QDR3P38227 689 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YMR262WP38430 313 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data4.63□□□□□ -1.67not detected
YKL169CYKL169C PRP39P39682 629 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YIL169CP40442 995 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C PAC11P40960 533 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C LOH1P47055 219 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YNL260CP53846 198 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C SRL4Q03085 281 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ERP1Q05359 219 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C IMA2Q08295 589 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C SGT1Q08446 395 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C GLE1Q12315 538 aa4.63□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C CHS1P08004 1131 aa4.62□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C FUS3P16892 353 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C YUR1P26725 428 aa4.62□□□□□ -1.67
YKL169CYKL169C ITR1P30605 584 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.6 ms