RNA–Protein interactions for RNA: YKL146W

AVT3, Transcript of Vacuolar transporter, yeast

Gene AVT3, Length 2,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT3	YKL146W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	VPS33	P20795	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RER1	P25560	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	DOA1	P36037	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	QDR2	P40474	542 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	ALR2	P43553	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	FAR7	P43592	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	HOC1	P47124	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	IBA57	P47158	497 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	BNI4	P53858	892 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	STP3	Q05937	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	SWA2	Q06677	668 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	MCA1	Q08601	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	GLO4	Q12320	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	HSP42	Q12329	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
AVT3	YKL146W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	FAR1	P21268	830 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	MKK1	P32490	508 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YJL068C	P40363	299 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	MPM1	P40364	252 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YRB2	P40517	327 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	HIS6	P40545	261 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	MPH1	P40562	993 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YGR201C	P42936	225 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	RHO4	Q00246	291 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SED5	Q01590	340 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	KRE28	Q04431	385 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	OPT2	Q06593	877 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SFM1	Q12314	213 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SKS1	Q12505	502 aa		4.84	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	CDC4	P07834	779 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	VMA3	P25515	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	PCL2	P25693	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	NUF2	P33895	451 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	UTH1	P36135	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YAR028W	P39548	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YGR079W	P53249	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	DCI1	Q08558	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YRO2	P38079	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	BIG1	P38813	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	TDA11	P38854	504 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YFL066C	P43538	392 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	CDH1	P53197	566 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	RSC9	Q03124	581 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	RIM13	Q03792	727 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	DIC1	Q06143	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	FDH1	Q08911	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	GLE1	Q12315	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	RPB5	P20434	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	MRPS28	P21771	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	CTR86	P25355	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YMC1	P32331	307 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	RPC82	P32349	654 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	LYP1	P32487	611 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	MRPL6	P32904	214 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	BCK2	P33306	851 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	HCS1	P34243	683 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	TUL1	P36096	758 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	MTG2	P38860	518 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	TED1	P40533	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	CFD1	P40558	293 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	STE24	P47154	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	REC102	Q02721	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SPO19	Q03029	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	HDA2	Q06629	674 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SCM3	Q12334	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AVT3	YKL146W	SEC39	Q12745	709 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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