RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	FIG1	P38224	298 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	TSC10	P38342	320 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	HIS2	P38635	335 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CIN4	P39110	191 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	IRC7	P43623	340 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPC17	P47076	161 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	BIO4	P53630	237 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MRPL22	P53881	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	NRG1	Q03125	231 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ARO10	Q06408	635 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RRI1	Q12468	440 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MAS2	P11914	482 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	WHI2	P12611	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	NUF2	P33895	451 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LNP1	P38878	278 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPH1	P39956	796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YPS6	P40583	537 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PHO86	P46956	311 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RAV1	P47104	1357 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YGL117W	P53133	265 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MPS1	P54199	764 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CTF19	Q02732	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GIS1	Q03833	894 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CDA2	Q06703	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
IKS1	YJL057C	SNF8	Q12483	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	OPI3	P05375	206 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	POX1	P13711	748 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YMR31	P19955	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DAL82	P21705	255 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	REC114	P32841	428 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	BMT2	P38278	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPP1	P38786	293 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YGR210C	P42942	411 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CTH1	P47976	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YGR168C	P53293	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ZRG17	P53735	605 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GCN5	Q03330	439 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DUS4	Q06063	367 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	FSH3	Q99369	266 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CLN3	P13365	580 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CHS2	P14180	963 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	MET22	P32179	357 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	POG1	P40473	351 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	AGP3	P43548	558 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	GET1	P53192	235 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SMP3	Q04174	516 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	KRE28	Q04431	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SPC24	Q04477	213 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PTP1	P25044	335 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LAC1	P28496	418 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YOX1	P34161	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	LHS1	P36016	881 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	BNA4	P38169	460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	YMR134W	P40207	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	OST6	Q03723	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	UBX2	Q04228	584 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	PEX12	Q04370	399 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	CSM4	Q08955	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	SIA1	Q12212	622 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.15	□□□□□ -1.74
IKS1	YJL057C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	PDR3	P33200	976 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IKS1	YJL057C	ANS1	P38832	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.8 ms