RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	YGR079W	P53249	370 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ENT2	Q05785	613 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MCM21	Q06675	368 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SRO7	Q12038	1033 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MET17	P06106	444 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SIR3	P06701	978 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PUT2	P07275	575 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PPH21	P23594	369 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	CTS1	P29029	562 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	NNK1	P36003	928 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	KRE29	P40026	464 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SPO73	P40031	143 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	GPI8	P49018	411 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ROG1	P53118	685 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SLD3	P53135	668 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.48	not detected
YCK1	YHR135C	YML096W	Q04489	525 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	IES3	Q12345	250 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MED11	Q99278	115 aa		5.77	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ITR2	P30606	609 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SRX1	P36077	127 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SCO2	P38072	301 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ATG14	P38270	344 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SOK1	P40317	901 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YJL049W	P47048	450 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	CDH1	P53197	566 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SKS1	Q12505	502 aa		5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
YCK1	YHR135C	NTH1	P32356	751 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	PIM1	P36775	1133 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	5.76	□□□□□ -1.49	not detected
YCK1	YHR135C	LRO1	P40345	661 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YGR201C	P42936	225 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	CIS3	P47001	227 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SHE4	P51534	789 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YGR045C	P53229	120 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RHO4	Q00246	291 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RSC9	Q03124	581 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	BOP2	Q06150	570 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YFT2	Q06676	274 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	NTG2	Q08214	380 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	NFI1	Q12216	726 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MRX4	Q12467	430 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	MDM35	O60200	86 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	STE7	P06784	515 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	VPS33	P20795	691 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	BUB3	P26449	341 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RPC82	P32349	654 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	DOM34	P33309	386 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	NUF2	P33895	451 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	SEA4	P38164	1038 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	EHT1	P38295	451 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YAL037W	P39728	267 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	EFM3	P47163	339 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	COG5	P53951	403 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YPL107W	Q02873	248 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TRM82	Q03774	444 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	FMP42	Q04991	504 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	YLR345W	Q06137	509 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	ARO10	Q06408	635 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	FMP45	Q07651	309 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	GSH2	Q08220	491 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	BSC1	Q12140	328 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	COX3	P00420	269 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YCK1	YHR135C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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