RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	CKA2	P19454	339 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	MET22	P32179	357 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YMR134W	P40207	237 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	COG2	P53271	262 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ORC3	P54790	616 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	PLM2	Q04383	521 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RNH203	Q12338	110 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	FKS3	Q04952	1785 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	STE4	P18851	423 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	APL3	P38065	1025 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	MMS21	P38632	267 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	SAS2	P40963	338 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	LIF1	P53150	421 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YGR151C	P53287	111 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	COQ11	Q05892	277 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DUS4	Q06063	367 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	GMC2	Q06201	188 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ARR2	Q06597	130 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RKI1	Q12189	258 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	FSH3	Q99369	266 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	CHO1	P08456	276 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RRT12	P25381	491 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DOA1	P36037	715 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DSN1	P40568	576 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	BUR2	Q05949	395 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	TLG2	Q08144	397 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DSE3	Q08729	430 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	VIK1	Q12045	647 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YPR1	Q12458	312 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	PMA2	P19657	947 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	LDB7	P38210	180 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	BIG1	P38813	335 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	UBA4	P38820	440 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YEL020C	P39994	560 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	MRX5	P47007	382 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	MRPL50	P53724	139 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DLT1	Q04216	342 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ARO10	Q06408	635 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YLR040C	Q07988	224 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	IRC13	Q08630	104 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	TIP41	Q12199	356 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	FRE7	Q12333	620 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	NCB2	Q92317	146 aa		3.91	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RAD9	P14737	1309 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	ATP7	P30902	174 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	BNA4	P38169	460 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	PFS1	P38872	237 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	DIA1	P54005	336 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	FMP30	Q02883	468 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	NUP53	Q03790	475 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	HSP31	Q04432	237 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	USV1	Q12132	391 aa		3.9	□□□□□ -1.78
SYF1	YDR416W	SRB8	P25648	1427 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YSR3	P23501	404 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PEX3	P28795	441 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	HIS2	P38635	335 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	DSE1	P40077	573 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SAD1	P43589	448 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	PMT5	P52867	743 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	TAF6	P53040	516 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	NMA2	P53204	395 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YMR209C	Q03648	457 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	AIM33	Q04516	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SIA1	Q12212	622 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	RGS2	Q99188	309 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MET3	P08536	511 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	MSN2	P33748	704 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	YPK3	P38070	525 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	ARP1	P38696	384 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF1	YDR416W	SUR2	P38992	349 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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