RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	CAND2	O75155	1236 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	KATNA1	O75449	491 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	AMH	P03971	560 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	SLPI	P03973	132 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ITGA1	P56199	1179 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	NKX3-2	P78367	333 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	UBE4A	Q14139	1066 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	BRD3	Q15059	726 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MBLAC2	Q68D91	279 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF180	Q86T96	592 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MTMR8	Q96EF0	704 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MMP19	Q99542	508 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS11	Q9H270	941 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR27	Q9NS67	375 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.18	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	SHTN1	A0MZ66	631 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MSC	O60682	206 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP7B1	O75881	506 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	LCP1	P13796	627 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	CPE	P16870	476 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	IL13	P35225	146 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	LTBR	P36941	435 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNAB2	Q13303	367 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ICAM4	Q14773	271 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	INF2	Q27J81	1249 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702		Q8N1X5	172 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	DPF3	Q92784	378 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF747	Q9BV97	191 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		5.17	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ARVCF	O00192	962 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	AQP7	O14520	342 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	B4GALT3	O60512	393 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	CRTAM	O95727	393 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ASL	P04424	464 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC6A11	P48066	632 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR85	P60893	370 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP2CB	P62714	309 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP2CA	P67775	309 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF460	Q14592	562 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	CDSN	Q15517	529 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MROH9	Q5TGP6	573 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	IQCE	Q6IPM2	695 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	DIO2	Q92813	273 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		5.16	□□□□□ -1.58
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL1	P05976	194 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNA6	P17658	529 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	STAT5A	P42229	794 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	NEK2	P51955	445 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	MCL1	Q07820	350 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	STRN3	Q13033	797 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	RALBP1	Q15311	655 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	LBX2	Q6XYB7	198 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CHPF	Q8IZ52	775 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CLIC6	Q96NY7	704 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	WNT9A	O14904	365 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3BP5	O60239	455 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF28	P17035	718 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	IGFALS	P35858	605 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB27A	P51159	221 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	ITK	Q08881	620 aa		5.14	□□□□□ -1.59
FAM49B-222	ENST00000522702	CR1L	Q2VPA4	569 aa		5.14	□□□□□ -1.59

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