RNA–Protein interactions for RNA: YPL079W

RPL21B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L21B, yeast

Gene RPL21B, Length 483 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL21B	YPL079W	PPH21	P23594	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RNQ1	P25367	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ADE1	P27616	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ARO7	P32178	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NTH1	P32356	751 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPK3	P38070	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SCO2	P38072	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MNT3	P40549	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MAD2	P40958	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ALR2	P43553	858 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	GPI8	P49018	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SHE4	P51534	789 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MTQ1	P53944	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RHO4	Q00246	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RSC9	Q03124	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YMD8	Q03697	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TRM82	Q03774	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RNH202	Q05635	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ARO10	Q06408	635 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MSH5	Q12175	901 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	HER1	Q12276	1246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TRM10	Q12400	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MRX4	Q12467	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MET2	P08465	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SAM35	P14693	329 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TEC1	P18412	486 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	VPS33	P20795	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CLB3	P24870	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SFC1	P33303	322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ATG14	P38270	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PEX18	P38855	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	NEO1	P40527	1151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YGR201C	P42936	225 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	SWP82	P43554	623 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CIS3	P47001	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RPA14	P50106	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	TWF1	P53250	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	COG5	P53951	403 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RSM24	Q03976	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	HPF1	Q05164	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ENT2	Q05785	613 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MMT2	Q08970	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	RAD59	Q12223	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL21B	YPL079W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SEC2	P17065	759 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SLY41	P22215	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	CLB2	P24869	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ARE1	P25628	610 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	PUP2	P32379	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SFA1	P32771	386 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RIB7	P33312	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	LOT5	P34234	306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ARN2	P38724	620 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BIG1	P38813	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
RPL21B	YPL079W	CEM1	P39525	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RRG9	P40156	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YNL195C	P40168	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	LRO1	P40345	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	AIM20	P40451	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BIT61	P47041	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YJL049W	P47048	450 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	TOS2	P50078	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	SCW11	P53189	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MEP3	P53390	489 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	NUP49	Q02199	472 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	REC102	Q02721	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	MAK3	Q03503	176 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RIM13	Q03792	727 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	ARP10	Q04549	284 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RSF1	Q05043	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BOP2	Q06150	570 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	VPS36	Q06696	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	RPN13	O13563	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPL21B	YPL079W	STE7	P06784	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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