RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	MET17	P06106	444 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	SLY41	P22215	453 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YMC1	P32331	307 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	not detected
AMD1	YML035C	RBG1	P39729	369 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	AGP3	P43548	558 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	PAC10	P48363	199 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YKR005C	Q02203	525 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MMT2	Q08970	484 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	NFI1	Q12216	726 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YDR061W	Q12298	539 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MDM12	Q92328	271 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	VPS33	P20795	691 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	NPR1	P22211	790 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	PET112	P33893	541 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	FES1	P38260	290 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	GPI8	P49018	411 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	ORM1	P53224	222 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RHO4	Q00246	291 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MSC1	Q03104	513 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YLR456W	Q06199	204 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	ARR1	Q06596	294 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YEH1	Q07804	573 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YLR036C	Q07986	203 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	BSC6	Q08280	497 aa		5.39	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	HOP1	P20050	605 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	SEA4	P38164	1038 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	ATG14	P38270	344 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	FAA3	P39002	694 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YJL068C	P40363	299 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	QDR2	P40474	542 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	EFM3	P47163	339 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YLR126C	Q12288	251 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YDL199C	Q12407	687 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RPN13	O13563	156 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YHR177W	P38867	453 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	NRM1	P53718	249 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YNL181W	P53878	407 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RSM24	Q03976	319 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MGR3	Q04472	501 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	GIC2	Q06648	383 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RSA1	Q08932	381 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	IMG1	P25626	169 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	TAF14	P35189	244 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MRPL15	P36523	253 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	AIM2	P39721	246 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YEL020C	P39994	560 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	CFD1	P40558	293 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	IBA57	P47158	497 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	ATF2	P53296	535 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	NTG2	Q08214	380 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MCA1	Q08601	432 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YOR389W	Q08912	624 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	GAL4	P04386	881 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	ARE1	P25628	610 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	COG3	P40094	801 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	FAU1	P40099	211 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	SWP82	P43554	623 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	SNF12	P53628	566 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	COG5	P53951	403 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RRN5	Q02983	363 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	SFM1	Q12314	213 aa		5.37	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MER1	P16523	270 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	RPB5	P20434	215 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	MKK1	P32490	508 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	PEX18	P38855	283 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YIL086C	P40503	102 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	TIM54	P47045	478 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	PLP1	Q04004	230 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	GPI17	Q04080	534 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	SPO77	Q06134	477 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	GLE1	Q12315	538 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YCR006C	P25350	157 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
AMD1	YML035C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms