RNA–Protein interactions for RNA: YKL034W

TUL1, Transcript of Subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene TUL1, Length 2,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TUL1	YKL034W	MSS51	P32335	436 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YGL015C	P33199	130 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	TRM2	P33753	639 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YER130C	P39959	443 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YNR066C	P53752	436 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	UBX2	Q04228	584 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	HTB2	P02294	131 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	AMD2	P22580	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	VMA16	P23968	213 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YCR101C	P25607	182 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	UBA4	P38820	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SPG5	P42933	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	TAX4	P47030	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	NIF3	P53081	288 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SHY1	P53266	389 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	MDM30	Q05930	598 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	CDA1	Q06702	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	DAS2	Q12084	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	EMP46	Q12396	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RMD5	Q12508	421 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RPC34	P32910	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	PDR3	P33200	976 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YAR028W	P39548	234 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YPT11	P48559	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YDL186W	P48568	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	CSM3	Q04659	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	TRM11	Q12463	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SWR1	Q05471	1514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SNF5	P18480	905 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YSP3	P25036	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	NDC1	P32500	655 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RAD24	P32641	659 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	APN2	P38207	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	CEM1	P39525	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	GIP2	P40036	548 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YNL195C	P40168	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SLM1	P40485	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	PRM10	P42946	383 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SWP82	P43554	623 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	IMO32	P53219	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	DYN3	Q04949	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	ASR1	Q06834	288 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	AAC1	P04710	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	PUT2	P07275	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YMR31	P19955	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	MCH2	P36032	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YKL162C	P36052	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	PRK1	P40494	810 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	UBP16	Q02863	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	CCE1	Q03702	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YDR344C	Q05510	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	GLO2	Q05584	274 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RIF2	Q06208	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	POS5	Q06892	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	HMS1	Q12398	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	COQ4	O13525	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	SIR3	P06701	978 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	ERG9	P29704	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	COA1	P40452	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	BAP3	P41815	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	IRC8	P47046	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	GET1	P53192	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TUL1	YKL034W	GPI1	P53306	609 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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