RNA–Protein interactions for RNA: YJL110C

GZF3, Transcript of GATA zinc finger protein, yeast

Gene GZF3, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GZF3	YJL110C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SIN3	P22579	1536 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PPZ1	P26570	692 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PDR3	P33200	976 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SPC34	P36131	295 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YBR139W	P38109	508 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	NUP170	P38181	1502 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.88	□□□□□ -1.79	not detected
GZF3	YJL110C	PCI8	P40512	444 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SPG5	P42933	373 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YIP1	P53039	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	GPI15	P53961	229 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MSS11	Q03825	758 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	VPS74	Q06385	345 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RKM5	Q12367	367 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	CEX1	Q12453	761 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YAR066W	P0CX18	203 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YHR214W	P0CX19	203 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SEC62	P21825	274 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YUH1	P35127	236 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MDV1	P47025	714 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MPS1	P54199	764 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	IRC15	Q02733	499 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ECM7	Q06200	448 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YDL144C	Q07589	356 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RNH203	Q12338	110 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	TSC11	P40061	1430 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MDM10	P18409	493 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	HXT2	P23585	541 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MSK1	P32048	576 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SKN1	P33336	771 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ECM15	P35195	104 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	DOA1	P36037	715 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SWC5	P38326	303 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YHR122W	P38829	231 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PEX18	P38855	283 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YHR177W	P38867	453 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ALP1	P38971	573 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	VOA1	P53262	265 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	STD1	Q02794	444 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RSN1	Q03516	953 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	KRE28	Q04431	385 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ECM18	Q04623	453 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YEH2	Q07950	538 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YOR012W	Q12351	137 aa		3.87	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SAC3	P46674	1301 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ACH1	P32316	526 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.86	□□□□□ -1.79	not detected
GZF3	YJL110C	FRE2	P36033	711 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YBR056W	P38081	501 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	STP2	P38704	541 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PCL6	P40038	420 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	RET3	P53600	189 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	CAB5	Q03941	241 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SYO1	Q07395	620 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	APC5	Q08683	685 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YDL009C	Q12210	107 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PET123	P17558	318 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	LSB5	P25369	354 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YCR100C	P25606	316 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	KAR9	P32526	644 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	FRE1	P32791	686 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	COX13	P32799	129 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	COY1	P34237	679 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	YCR041W	P37265	110 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	ATM1	P40416	690 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	KEL2	P50090	882 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	FRE4	P53746	719 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GZF3	YJL110C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79

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