RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	YPR064W	Q12492	139 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YLR111W	Q12528	110 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MER1	P16523	270 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ECM4	P36156	370 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	COG3	P40094	801 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MSS2	P40990	351 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PRM10	P42946	383 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	FAR7	P43592	221 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SDT1	P53078	280 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	DAM1	P53267	343 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	APC4	Q04601	652 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ROY1	Q04847	553 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	AGP1	P25376	633 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RHB1	P25378	209 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MRPL6	P32904	214 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YKR015C	P36111	568 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MUM2	P38236	366 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	AIM2	P39721	246 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	CWC24	P53769	259 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	TEN1	Q07921	160 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	AVO1	Q08236	1176 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	REX4	Q08237	289 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YPR022C	Q12139	1133 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MSB2	P32334	1306 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	TPK3	P05986	398 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RED1	P14291	827 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	KSS1	P14681	368 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	CMP2	P14747	604 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RER1	P25560	188 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YIM1	P28625	365 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.8	□□□□□ -1.48	not detected
YCK1	YHR135C	MRPL37	P36532	105 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MNN2	P38069	597 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	BNA4	P38169	460 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	FAU1	P40099	211 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SSU1	P41930	458 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ZIM17	P42844	174 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RAD17	P48581	401 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SNF12	P53628	566 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SED5	Q01590	340 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	GRX5	Q02784	150 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RRN5	Q02983	363 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	DCI1	Q08558	271 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	GLE1	Q12315	538 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ADE1	P27616	306 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MKK1	P32490	508 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	HCS1	P34243	683 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	GOS1	P38736	223 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MTG2	P38860	518 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YHR177W	P38867	453 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PFS1	P38872	237 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MAD2	P40958	196 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PRM8	P53174	237 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	FHN1	P53279	174 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SWP1	Q02795	286 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	OAZ1	Q02803	292 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	TLG1	Q03322	224 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SPO77	Q06134	477 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RRT8	Q08219	342 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MHF1	Q3E835	90 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RIB3	Q99258	208 aa		5.79	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YCL049C	P25577	312 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	SFC1	P33303	322 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	TUL1	P36096	758 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	YHR033W	P38690	423 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	WSC4	P38739	605 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	MNT3	P40549	630 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PAC11	P40960	533 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	HXT16	P47185	567 aa		5.78	□□□□□ -1.48
YCK1	YHR135C	PAC10	P48363	199 aa		5.78	□□□□□ -1.48

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