RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	IVY1	Q04934	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	STF1	P01098	86 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RPB8	P20436	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	MEI4	P29467	408 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ARA1	P38115	344 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	TCD1	P38756	429 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	PRM9	P39551	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RRT5	P43607	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	IRC7	P43623	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SNG1	P46950	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	TAX4	P47030	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	AIM22	P47051	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	KAP114	P53067	1004 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YGL108C	P53139	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SMA1	Q02651	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SWF1	Q04629	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	THP1	Q08231	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	MSB2	P32334	1306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RHO2	P06781	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	URA4	P20051	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	DAL81	P21657	970 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	BRF1	P29056	596 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	CSE1	P33307	960 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	MRPL40	P36534	297 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	UBA4	P38820	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YEL028W	P39989	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YIL060W	P40519	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	TIM13	P53299	105 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ATP23	P53722	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ACL4	Q03771	387 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	DAS2	Q12084	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SKS1	Q12505	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	IZH4	Q99393	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	UBR1	P19812	1950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YLR462W	O13556	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SEC63	P14906	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	PET123	P17558	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SPO7	P18410	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	HOT13	P36078	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YHL049C	P38722	271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	OSW5	P40219	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ATM1	P40416	690 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SER33	P40510	469 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YFL064C	P43540	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	EMC4	P53073	190 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SHR3	Q02774	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	ERV41	Q04651	352 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
CIA2	YHR122W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	UAF30	Q08747	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RDR1	Q08904	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	PFA4	Q12006	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	AEP3	Q12089	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SEY1	Q99287	776 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RAD10	P06838	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SLY1	P22213	666 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	GEX1	P25596	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	HXT1	P32465	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SMI1	P32566	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	PIM1	P36775	1133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	BNA4	P38169	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YBP1	P38315	674 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YHR210C	P38893	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	SER3	P40054	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	VRG4	P40107	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YJL132W	P47014	750 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	AIM23	P47015	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	FLC3	P53121	802 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	AQR1	P53943	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CIA2	YHR122W	PIR1	Q03178	341 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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