RNA–Protein interactions for RNA: YBL062W

YBL062W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YBL062W, Length 381 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL062WYBL062W SMC5Q08204 1093 aa3.31□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W IMA3P0CW40 589 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W IMA4P0CW41 589 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W PDX1P16451 410 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W TFB1P32776 642 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W SPT10P35208 640 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W CLD1P53264 445 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W YMR102CQ03177 834 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W YDR131CQ03899 556 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W IMA2Q08295 589 aa3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W COX3P00420 269 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W YHR131CP38835 850 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W VHS2P40463 436 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W TOS3P43637 560 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W AIM24P47127 394 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W BIR1P47134 954 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W OCA2P53949 197 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W NCA2Q12374 616 aa3.29□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W CPR2P23285 205 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W EXG1P23776 448 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W HSP104P31539 908 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W SIM1P40472 476 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W HAC1P41546 238 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W VHS1Q03785 461 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W EAF3Q12432 401 aa3.28□□□□□ -1.88
YBL062WYBL062W CAP2P13517 287 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W CLB1P24868 471 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W RPC53P25441 422 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W CYS4P32582 507 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W OM14P38325 134 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W AEP3Q12089 606 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YDL012CQ12489 107 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YBL111CQ3E7Y5 667 aa3.27□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W PIS1P06197 220 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W DPH5P32469 300 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YEF1P32622 495 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W STN1P38960 494 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W BNS1P50084 137 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W AHC1Q12433 566 aa3.26□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W PSK1P31374 1356 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.25□□□□□ -1.89not detected
YBL062WYBL062W ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YHK8P38776 514 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W PTI1P39927 425 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W OXA1P39952 402 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ATG18P43601 500 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YET2Q04210 160 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YDL114WQ07530 308 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W VPS54Q12071 889 aa3.25□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W DST1P07273 309 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ARO3P14843 370 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W CDC50P25656 391 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ERV1P27882 189 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W MRPS9P38120 278 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W BAT1P38891 393 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W LCB3P47013 409 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W TCB2P48231 1178 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W CRH1P53301 507 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W RMT2Q03305 412 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W NSE1Q07913 336 aa3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W POM152P39685 1337 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W COX4P04037 155 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W SKT5P34226 696 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ALD5P40047 520 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YER079WP40052 210 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YER186CP40101 306 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W AIP1P46680 615 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YGR117CP53270 476 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W MKC7P53379 596 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W COS1P53822 381 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W TDA1Q03533 586 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W LIP2Q06005 328 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W NAG1Q8TGN9 163 aa3.23□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W SKN1P33336 771 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W INM1P38710 295 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W SEO1P39709 593 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W EGT2P42835 1041 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W ECM11Q04110 302 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W AIM32Q04689 311 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W YPQ1Q12010 308 aa3.22□□□□□ -1.89
YBL062WYBL062W CDC21P06785 304 aa3.21□□□□□ -1.9
YBL062WYBL062W ALG1P16661 449 aa3.21□□□□□ -1.9
YBL062WYBL062W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.21□□□□□ -1.9not detected
YBL062WYBL062W DEP1P31385 405 aa3.21□□□□□ -1.9
YBL062WYBL062W DBF4P32325 704 aa3.21□□□□□ -1.9
YBL062WYBL062W COX13P32799 129 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms