RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA VMA8P32610 256 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PXA2P34230 853 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA SBE22P38814 852 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA SIM1P40472 476 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YLR456WQ06199 204 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA MDM36Q06820 579 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA DCI1Q08558 271 aa2.57□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA DST1P07273 309 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA RPB5P20434 215 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA RIM1P32445 135 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CSE2P33308 149 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA INM1P38710 295 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YER079WP40052 210 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA TOS3P43637 560 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YJR085CP47131 105 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA MRM2P53123 320 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA VPS9P54787 451 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PLP2Q12017 286 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA JID1Q12350 301 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA NCA2Q12374 616 aa2.56□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CDC21P06785 304 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA FAD1P38913 306 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA TIS11P47977 285 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PIB2P53191 635 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA ALF1P53904 254 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA NSE1Q07913 336 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA LOT6Q07923 191 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA GPM3Q12326 303 aa2.55□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PRS1P32895 427 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA MRPL10P36520 322 aa2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA GAB1P41733 394 aa2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA ADA2Q02336 434 aa2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CMS1Q07897 291 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA IZH2Q12442 317 aa2.54□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CAP2P13517 287 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA MSI1P13712 422 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA ALG1P16661 449 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PRR1P28708 518 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA NUP2P32499 720 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA SKN1P33336 771 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA MAM33P40513 266 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA CHS6P40955 746 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YMR102CQ03177 834 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA RIF2Q06208 395 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA NDL1Q06568 189 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA SMC5Q08204 1093 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA SPE3Q12074 293 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PDE2P06776 526 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YEF1P32622 495 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA COX13P32799 129 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA SKT5P34226 696 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA STP2P38704 541 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YFR057WP43625 151 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA YGR117CP53270 476 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA SXM1Q04175 944 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA PRM6Q04705 352 aa2.53□□□□□ -2
15S_rRNA15S_rRNA POM152P39685 1337 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2.52□□□□□ -2.01not detected
15S_rRNA15S_rRNA PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA PHO91P27514 894 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data2.52□□□□□ -2.01not detected
15S_rRNA15S_rRNA YHR131CP38835 850 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA GPI16P38875 610 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA PAC11P40960 533 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA HAC1P41546 238 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA LCB3P47013 409 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA AIM24P47127 394 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA MST27P53176 234 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA RRP46P53256 223 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA BSC6Q08280 497 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA EAF3Q12432 401 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA ERP4Q12450 207 aa2.52□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA YKL097CP34245 136 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA RTC2P38279 296 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA LRP1P38801 184 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA YJL055WP47044 245 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA BIR1P47134 954 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA STE24P47154 453 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA COS1P53822 381 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA SPR6Q01684 191 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA HAL1Q01766 294 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA YDR541CQ03049 344 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA TSA2Q04120 196 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA GYL1Q04322 720 aa2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA RPN5Q12250 445 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA RPL12BP0CX54 165 aa2.5□□□□□ -2.01
15S_rRNA15S_rRNA NAT1P12945 854 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
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