RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YLR278C	Q05854	1341 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ASP3-2	P0CX77	362 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ASP3-3	P0CX78	362 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ASP3-4	P0CX79	362 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RAD14	P28519	371 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YEF1	P32622	495 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
snR46	snR46	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YHR054C	P38780	354 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	FHL1	P39521	936 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	LYS14	P40971	790 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	LCB3	P47013	409 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YJR030C	P47101	745 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YGR149W	P48236	432 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	PHB2	P50085	310 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	OAZ1	Q02803	292 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	CEX1	Q12453	761 aa		0.45	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RRN3	P36070	627 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ATG12	P38316	186 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YIL059C	P40520	121 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	VEL1	P53058	206 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	NGL3	Q03210	505 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	MRX8	Q05473	314 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RIM20	Q12033	661 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	EAF3	Q12432	401 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RMD5	Q12508	421 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		0.44	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	NIP100	P33420	868 aa		0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ECM34	P38728	170 aa		0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	WSC4	P38739	605 aa		0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ZRG17	P53735	605 aa		0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	CCE1	Q03702	353 aa		0.43	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SPO12	P17123	173 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SNF6	P18888	332 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YCL068C	P25593	260 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SIN4	P32259	974 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	PHA2	P32452	334 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SRB2	P34162	210 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	TRR2	P38816	342 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SAS2	P40963	338 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YGR066C	P53242	292 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	RGM1	Q00453	211 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YOR338W	Q99326	363 aa		0.42	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	CMK2	P22517	447 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	TOM20	P35180	183 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	DOT5	P40553	215 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	VHT1	P53241	593 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	TDA1	Q03533	586 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	MDM36	Q06820	579 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	MFG1	Q07684	458 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	LOT6	Q07923	191 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	NMD4	Q12129	218 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SEC39	Q12745	709 aa		0.41	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	STE7	P06784	515 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	MRE11	P32829	692 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	PDC2	P32896	925 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	SOL2	P37262	315 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	VHC1	P38329	1120 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	YHK8	P38776	514 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	FLC2	P39719	783 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	INP2	Q03824	705 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	RAX1	Q08760	435 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	YML133C	Q03099	1374 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	YLL067C	Q07888	1374 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	YLL066C	Q99208	1374 aa		0.4	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	FOB1	O13329	566 aa		0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	CDC16	P09798	840 aa		0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	DAL5	P15365	543 aa		0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	CTR86	P25355	563 aa		0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	CST26	P38226	397 aa		0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	COS4	P43542	379 aa		0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	MIX17	Q03667	156 aa		0.39	□□□□□ -2.35
snR46	snR46	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	0.39	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.1 ms