RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SER3	P40054	469 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	ELO3	P40319	345 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	AYR1	P40471	297 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RMD8	P43620	662 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SNG1	P46950	547 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	ECL1	P48235	211 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	GTO1	P48239	356 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	EFM6	P53970	246 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	NUP100	Q02629	959 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SMA1	Q02651	245 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	PIR3	Q03180	325 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YLR345W	Q06137	509 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YPS7	Q06325	596 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	PEX27	Q08580	376 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	UPC2	Q12151	913 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	ACF2	Q12168	779 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YLR126C	Q12288	251 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	NDJ1	Q12366	352 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	AHC1	Q12433	566 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	FMP16	Q12497	93 aa		5.2	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DST1	P07273	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	HMG1	P12683	1054 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RHB1	P25378	209 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SPT14	P32363	452 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	PPQ1	P32945	549 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	FUI1	P38196	639 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	FTH1	P38310	465 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DDI1	P40087	428 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	MEP2	P41948	499 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	ALR2	P43553	858 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	HXT16	P47185	567 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	NAS6	P50086	228 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YNL034W	P53963	612 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DML1	Q03652	475 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YLL007C	Q07799	665 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	GTT2	Q12390	233 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	ATG31	Q12421	196 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YPR1	Q12458	312 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SNF8	Q12483	233 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	MDM12	Q92328	271 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	PDE2	P06776	526 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DAP2	P18962	818 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	DUT1	P33317	147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	NIC96	P34077	839 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RGI2	P40188	164 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YKE4	P40544	346 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	UFE1	P41834	346 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YGR210C	P42942	411 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SSY5	P47002	699 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	MRX6	P48564	524 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	TOM22	P49334	152 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	MRH4	P53166	561 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YGR168C	P53293	376 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	TNA1	P53322	534 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SPP2	Q02521	185 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	PFA5	Q03289	374 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YMD8	Q03697	442 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	EMI1	Q04406	187 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YDR124W	Q04608	324 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	BSP1	Q06604	576 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	MFG1	Q07684	458 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	LDB18	Q07887	179 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	THP1	Q08231	455 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YPQ1	Q12010	308 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RTR2	Q12378	196 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	ICT1	Q12385	394 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YDL199C	Q12407	687 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	UBR1	P19812	1950 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	SPS1	P08458	490 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	OCA4	P25366	362 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	ATG22	P25568	528 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	GLG1	P36143	616 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	BAP2	P38084	609 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	YHL041W	P38730	149 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	HXT7	P39004	570 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	RPH1	P39956	796 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RPT4	YOR259C	IRC24	P40580	263 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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