RNA–Protein interactions for RNA: YKR011C

YKR011C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR011C, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR011C	YKR011C	ALG5	P40350	334 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	FMS1	P50264	508 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YGL138C	P53122	345 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	BOR1	P53838	576 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	IPI3	P53877	555 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	GIM3	P53900	129 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SKO1	Q02100	647 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SLD5	Q03406	294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ACL4	Q03771	387 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YFH1	Q07540	174 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	TLG2	Q08144	397 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RAD61	Q99359	647 aa		3.12	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	CBS2	P14905	389 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SPO7	P18410	259 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	NDI1	P32340	513 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	FRE1	P32791	686 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	COT1	P32798	439 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SHP1	P34223	423 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	MRPL37	P36532	105 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YBR139W	P38109	508 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SSO2	P39926	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	INA22	P40576	216 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ECM27	P47144	725 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	COS5	P47187	383 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YGR149W	P48236	432 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YGL242C	P53066	181 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	PRM1	P53835	661 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	FIN1	Q03898	291 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	COQ9	Q05779	260 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	COS7	Q07788	383 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SIL1	Q08199	421 aa		3.11	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	HEM2	P05373	342 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ATR1	P13090	542 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	URA4	P20051	364 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	VPS3	P23643	1011 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YCR022C	P25620	114 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	UTR4	P32626	227 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	TPO5	P36029	618 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	PMU1	P36069	295 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	PIM1	P36775	1133 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	AVT5	P38176	459 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YBP1	P38315	674 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ATC1	Q04005	294 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YMR130W	Q04223	302 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	IVY1	Q04934	453 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	VPS74	Q06385	345 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	MDM36	Q06820	579 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	THP1	Q08231	455 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RSA1	Q08932	381 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RBD2	Q12270	262 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SFG1	Q12507	346 aa		3.1	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	CDC42	P19073	191 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	CLN1	P20437	546 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ELO2	P25358	347 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RDS1	P25611	832 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	KRE6	P32486	720 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	MSN4	P33749	630 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YKL070W	P36087	169 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	DUG2	P38149	878 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	MSG5	P38590	489 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	MSR1	P38714	643 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	FAD1	P38913	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	SHO1	P40073	367 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	ALG8	P40351	577 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	IDP2	P41939	412 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	URB2	P47108	1174 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YIP5	P53108	310 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YNL050C	P53952	270 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	IRC15	Q02733	499 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	PDS5	Q04264	1277 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	LDB17	Q12342	491 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.09	□□□□□ -1.91
YKR011C	YKR011C	PDE2	P06776	526 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YKR011C	YKR011C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
YKR011C	YKR011C	EXO70	P19658	623 aa		3.08	□□□□□ -1.92
YKR011C	YKR011C	SAG1	P20840	650 aa		3.08	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.7 ms