RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	RMD8	P43620	662 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CIS3	P47001	227 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RSM23	Q01163	450 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	IVY1	Q04934	453 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	COQ9	Q05779	260 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	GPM2	Q12008	311 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PRR1	P28708	518 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TKL2	P33315	681 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	UBP11	P36026	717 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YBR056W	P38081	501 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MAL32	P38158	584 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TAE1	P38340	232 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CTM1	P38818	585 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SEO1	P39709	593 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	HEM14	P40012	539 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YER186C	P40101	306 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SER33	P40510	469 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YFR018C	P43599	363 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YJR054W	P47114	497 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RTT102	P53330	157 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MAL12	P53341	584 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MKC7	P53379	596 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TEP1	P53916	434 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	HUA2	Q12134	243 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YDR018C	Q12185	396 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	GLE1	Q12315	538 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TMA17	Q12513	150 aa		1	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CDC16	P09798	840 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MTF2	P10849	440 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	REC107	P21651	314 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	DAL81	P21657	970 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MAK31	P23059	88 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	GRR1	P24814	1151 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SNT1	P25357	1226 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-C	P25383	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YCR102C	P25608	368 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SSH4	P32343	579 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NFU1	P32860	256 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MYO3	P36006	1272 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YHR054C	P38780	354 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
PAM16	YJL104W	AVT2	P39981	480 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	FIS1	P40515	155 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RPC17	P47076	161 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TRM9	P49957	279 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	COG7	P53195	279 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YNL146W	P53906	100 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YMR018W	Q04364	514 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CSI1	Q04368	295 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	AIM33	Q04516	312 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ECM7	Q06200	448 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TFC6	Q06339	672 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
PAM16	YJL104W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	APC5	Q08683	685 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NBP2	Q12163	236 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YOR342C	Q12182	319 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-B	Q12260	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YOL114C	Q12322	202 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YDR262W	Q12331	272 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		0.99	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	COX4	P04037	155 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.98	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25

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