RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	LSC2	P53312	427 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	DCN1	Q12395	269 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SIR4	P11978	1358 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	TOP3	P13099	656 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ADH7	P25377	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YCL068C	P25593	260 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ADE1	P27616	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	EPS1	P40557	701 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RPE1	P46969	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RTT102	P53330	157 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	BUD17	P53727	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ARL3	Q02804	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RSB1	Q08417	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	TAF10	Q12030	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SFM1	Q12314	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MAS2	P11914	482 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	BET2	P20133	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CKI1	P20485	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ATO2	P32907	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PDR3	P33200	976 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SRO77	P38163	1010 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MSC7	P38694	644 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	FAD1	P38913	306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	BDH1	P39714	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PUG1	P40100	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YAP5	P40574	245 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	HXT14	P42833	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YPT11	P48559	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PKP2	P53170	491 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	GET1	P53192	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YGR066C	P53242	292 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MPS1	P54199	764 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MFM1	Q02783	413 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	BUR2	Q05949	395 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YOP1	Q12402	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PRC1	P00729	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	NTH1	P32356	751 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SUV3	P32580	737 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	FMP23	P38231	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YBR197C	P38306	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	DER1	P38307	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SFB3	P38810	929 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	BAP3	P41815	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PHO86	P46956	311 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RPA14	P50106	137 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SKO1	Q02100	647 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YAP7	Q08182	245 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	EMP46	Q12396	444 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	FMP16	Q12497	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CBP1	P07252	654 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PEX3	P28795	441 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	AFG1	P32317	509 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	TFC1	P32367	649 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	GIP1	P38229	639 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YER121W	P40076	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	AMA1	P50082	593 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YGL235W	P53071	178 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MTC3	P53077	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ISU1	Q03020	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	NMD4	Q12129	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	YLR302C	O13544	120 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PEP5	P12868	1029 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SLY1	P22213	666 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	CPR3	P25719	182 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PXA1	YPL147W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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