RNA–Protein interactions for RNA: YOR299W

BUD7, Transcript of Member of the ChAPs family (Chs5p-Arf1p-binding proteins), yeast

Gene BUD7, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD7	YOR299W	PLB3	Q08108	686 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	UBX3	Q12229	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YPR089W	O13585	888 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	PTM1	P32857	523 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SKT5	P34226	696 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	MRPL37	P36532	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	EFM1	P38732	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	PTC7	P38797	343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	COA1	P40452	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	GAT1	P43574	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	MPS2	P53159	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RMI1	Q02685	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	PEX25	Q02969	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	GOT1	Q03554	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YPS7	Q06325	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
BUD7	YOR299W	REC107	P21651	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SEC15	P22224	910 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	VPS34	P22543	875 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	ASK1	P35734	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	MRPL36	P36531	177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	CTP1	P38152	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	UBA4	P38820	440 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	BZZ1	P38822	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	PFS1	P38872	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YEL073C	P39974	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SGF73	P53165	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	TNA1	P53322	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	CIK1	Q01649	594 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	TRI1	Q05024	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	NFI1	Q12216	726 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SKM1	Q12469	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YPT6	Q99260	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	STT4	P37297	1900 aa		4.63	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	CLB1	P24868	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	CIN8	P27895	1000 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SPR1	P32603	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	TFB1	P32776	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YBR062C	P38239	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	NBP35	P52920	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	AIF1	P52923	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	IMA1	P53051	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YSA1	Q01976	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	VHS1	Q03785	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	TRM12	Q04235	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	STE3	P06783	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SPT3	P06844	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	EXO70	P19658	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	POL4	P25615	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
BUD7	YOR299W	GIP4	P39732	760 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	GTR2	P53290	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	SNO2	P53823	222 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	STP4	Q07351	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	APC9	Q12107	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	RPC82	P32349	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	PUP2	P32379	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	MRX1	P40050	688 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	NAS6	P50086	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	MDM34	P53083	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	MRM2	P53123	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	YGR015C	P53208	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	TAF12	Q03761	539 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	FMN1	Q03778	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	ENT4	Q07872	247 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	XYL2	Q07993	356 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	NMD4	Q12129	218 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BUD7	YOR299W	UPC2	Q12151	913 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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