RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C YEH1Q07804 573 aa0.78□□□□□ -2.28
HAL9YOL089C YPT6Q99260 215 aa0.78□□□□□ -2.28
HAL9YOL089C DNF2Q12675 1612 aa0.78□□□□□ -2.28
HAL9YOL089C HSC82P15108 705 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MET8P15807 274 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RPN12P32496 274 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C PMT1P33775 817 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SPT10P35208 640 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MMS4P38257 691 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C IES5P40060 125 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YDL121CQ07541 149 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C TIM18Q08749 192 aa0.78□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RAD14P28519 371 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C APE3P37302 537 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C ECM8P38246 354 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C VHC1P38329 1120 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C NDE1P40215 560 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C HXT14P42833 540 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C PFS2P42841 465 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MTQ1P53944 314 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C HXT11P54862 567 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C OCA4P25366 362 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RTC2P38279 296 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MBB1P39534 108 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C AIM22P47051 409 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C APT1P49435 187 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YGL138CP53122 345 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YDR387CQ04162 555 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YRF1-1P0CX20 1796 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YRF1-5P0CX21 1796 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YRF1-8P0CX22 1796 aa0.77□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C CLB3P24870 427 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C FLC2P39719 783 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C BIR1P47134 954 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C ATG29Q12092 213 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YPR022CQ12139 1133 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RAD61Q99359 647 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C CAT8P39113 1433 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SPS4P09937 338 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MRP7P12687 371 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SAS3P34218 831 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MST28P39552 234 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YIL029CP40538 142 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YFR057WP43625 151 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YIP1P53039 248 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C PIB2P53191 635 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MTM1P53320 366 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C VPS75P53853 264 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C KTR6P54070 446 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C NUP116Q02630 1113 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C VPS54Q12071 889 aa0.76□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C KAR3P17119 729 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SPB1P25582 841 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C ATP3P38077 311 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C THI2P38141 450 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C OXA1P39952 402 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RPS0BP46654 252 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C VPS72Q03388 795 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C GYL1Q04322 720 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C AHC1Q12433 566 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SPE4Q12455 300 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C RHO2P06781 192 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C AAT2P23542 418 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C TIP1P27654 210 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C BRF1P29056 596 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C DBF4P32325 704 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C ATP11P32453 318 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C NOP4P37838 685 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C OTU2P38747 307 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SPO22P40511 975 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SYG1P40528 902 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C NCS2P53923 493 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C ISA2Q12425 185 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C POM152P39685 1337 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SSK2P53599 1579 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data0.75□□□□□ -2.29not detected
HAL9YOL089C ATP10P18496 279 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C URA4P20051 364 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C BEM1P29366 551 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C CYS4P32582 507 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C MUM2P38236 366 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C ECM27P47144 725 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YGL108CP53139 140 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SPC19Q03954 165 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C NDE2Q07500 545 aa0.75□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C SEM1O94742 89 aa0.74□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C TEF1P02994 458 aaKnown RBP0.74□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C YHR054CP38780 354 aa0.74□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data0.74□□□□□ -2.29not detected
HAL9YOL089C YFL012WP43580 148 aa0.74□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C TWF1P53250 332 aa0.74□□□□□ -2.29
HAL9YOL089C DIA1P54005 336 aa0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26 ms