RNA–Protein interactions for RNA: YOL063C

CRT10, Transcript of Protein involved in transcriptional regulation of RNR2 and RNR3, yeast

Gene CRT10, Length 2,874 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRT10	YOL063C	AAD4	Q07747	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	NUS1	Q12063	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ERP3	Q12403	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	FLP1	P03870	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	REP2	P03872	296 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SPS1	P08458	490 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SDH3	P33421	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SHP1	P34223	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	MCM7	P38132	845 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YAP1801	P38856	637 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	NVJ1	P38881	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YHR202W	P38887	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	AFG3	P39925	761 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	GID8	P40208	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	TIR3	P40552	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	GTT1	P40582	234 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	PMT4	P46971	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YNL018C	P53976	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	KTR6	P54070	446 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	GOT1	Q03554	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SSY1	Q03770	852 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	BUR2	Q05949	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	VPS74	Q06385	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	FRE5	Q08908	694 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	MTR10	Q99189	972 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	UBR1	P19812	1950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	APE1	P14904	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	BEM1	P29366	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SNC1	P31109	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RSM22	P36056	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	OSH7	P38755	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SEN34	P39707	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SWM2	P40342	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YFL052W	P43551	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
CRT10	YOL063C	CAF120	P53836	1060 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	IRC15	Q02733	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	NNT1	Q05874	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RIF2	Q06208	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RSC58	Q07979	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SIA1	Q12212	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	UTR4	P32626	227 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YBL010C	P32788	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	UIP5	P36137	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	APL3	P38065	1025 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YHR033W	P38690	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	NET1	P47035	1189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SPT20	P50875	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	CDC14	Q00684	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SNX41	Q04053	625 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YRM1	Q12340	786 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	MED4	Q12343	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	SAM35	P14693	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ERG9	P29704	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	IXR1	P33417	597 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	MRPL7	P36519	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	REG2	P38232	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RRG9	P40156	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	AIM22	P47051	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ISM1	P48526	1002 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	TIM44	Q01852	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	TDA1	Q03533	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	PSF1	Q12488	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	COX5A	P00424	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ARG80	P07249	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	APT2	P36973	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	COS8	P38723	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
CRT10	YOL063C	ATG18	P43601	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	STE24	P47154	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	HXT16	P47185	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	ERV29	P53337	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	RRN9	P53437	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRT10	YOL063C	INA17	Q02888	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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