RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	CBS2	P14905	389 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SPO7	P18410	259 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SPS22	P25380	463 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	GEX1	P25596	615 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RRN10	P38204	145 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	TCB2	P48231	1178 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YNR048W	P53740	393 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	MMR1	Q06324	491 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	ORT1	Q12375	292 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	ERP4	Q12450	207 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.69	□□□□□ -1.82	not detected
YNL171C	YNL171C	LSB5	P25369	354 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	MIX23	P38162	196 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YIL067C	P40514	678 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	OCA2	P53949	197 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	BET5	Q03630	159 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RRN11	Q04712	507 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	ESA1	Q08649	445 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RAD61	Q99359	647 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	CTR86	P25355	563 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	ITR1	P30605	584 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	PHO86	P46956	311 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YML6	P51998	286 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RSN1	Q03516	953 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	TAF12	Q03761	539 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	BUG1	Q12191	341 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SLY1	P22213	666 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	CPR4	P25334	318 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YBL059W	P34224	193 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YBR139W	P38109	508 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	AVT5	P38176	459 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	NDT80	P38830	627 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	FAA2	P39518	744 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	PHB2	P50085	310 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	CIK1	Q01649	594 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	PBA1	Q05778	276 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	AEP3	Q12089	606 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	MTR10	Q99189	972 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	HOM3	P10869	527 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SDH3	P33421	198 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	KKQ8	P36004	724 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	MTC6	P38849	526 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	NCA3	P46955	337 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YGR111W	P53265	400 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	GPI15	P53961	229 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	PPM1	Q04081	328 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	TLG2	Q08144	397 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YOR387C	Q08910	206 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RMD5	Q12508	421 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.65	□□□□□ -1.83	not detected
YNL171C	YNL171C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YAL037W	P39728	267 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SER3	P40054	469 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YPI1	P43587	155 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RSC1	P53236	928 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	TOF1	P53840	1238 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	HXT11	P54862	567 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	GYL1	Q04322	720 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SMA2	Q04658	369 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	DCI1	Q08558	271 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	VHS2	P40463	436 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
YNL171C	YNL171C	YGL242C	P53066	181 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RSA1	Q08932	381 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	GPM3	Q12326	303 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SPO12	P17123	173 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SWH1	P35845	1188 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YBR056W	P38081	501 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	PRM5	P40476	318 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	TOM22	P49334	152 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	AZR1	P50080	613 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	MDG1	P53885	366 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	ERV2	Q12284	196 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	ATG34	Q12292	412 aa		3.63	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.6 ms