RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN11	YML043C	YNL018C	P53976	612 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	OST6	Q03723	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	TRM82	Q03774	444 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	BCP1	Q06338	283 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	CDA2	Q06703	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GUD1	Q07729	489 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	GRX6	Q12438	231 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RRN11	YML043C	COX4	P04037	155 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CCA1	P21269	546 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CBP3	P21560	335 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	IFM1	P25038	676 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RRT12	P25381	491 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YIM1	P28625	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DGR2	P32330	852 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	VPS17	P32913	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PDR3	P33200	976 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HMT1	P38074	348 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	APN2	P38207	520 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YHR078W	P38799	552 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UBA4	P38820	440 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MNL1	P38888	796 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CKB2	P38930	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TMA108	P40462	946 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YIR035C	P40579	254 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MSS2	P40990	351 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YJL043W	P47053	257 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	IMA1	P53051	589 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TPN1	P53099	579 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	VOA1	P53262	265 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MRPS35	P53292	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YNR062C	P53748	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	COG5	P53951	403 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RSC9	Q03124	581 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RMT2	Q03305	412 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YML037C	Q03703	340 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CSN9	Q03981	162 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	VID22	Q05934	901 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	BOP2	Q06150	570 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RFU1	Q08003	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UAF30	Q08747	228 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ENV7	Q12003	364 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HFI1	Q12060	488 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HOS1	Q12214	470 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YPR1	Q12458	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HOG1	P32485	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CTF13	P35203	478 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	OAR1	P35731	278 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	VPS45	P38932	577 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RMD6	P39975	231 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	PCL6	P40038	420 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ATM1	P40416	690 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	TIR3	P40552	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	MND2	P40577	368 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HXT9	P40885	567 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	IDP2	P41939	412 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	GUF1	P46943	645 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YJL045W	P47052	634 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SPT20	P50875	604 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YML6	P51998	286 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UBC12	P52491	188 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ERV14	P53173	138 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	SWC4	P53201	476 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	YGR127W	P53275	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	HHO1	P53551	258 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	UBX4	P54730	416 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RRN11	YML043C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75

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