RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NDC1	YML031W	COR1	P07256	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	ATR1	P13090	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TFC1	P32367	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RIB7	P33312	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	MRP8	P35719	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	OMA1	P36163	345 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SRL3	P36167	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PHO89	P38361	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	VPS52	P39904	641 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	BAP3	P41815	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	MET12	P46151	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SDT1	P53078	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	MCH5	Q08777	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	IES3	Q12345	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RGS2	Q99188	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	COX6	P00427	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	CNA1	P23287	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	DCG1	P32460	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	ASK1	P35734	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SNL1	P40548	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	STB1	P42845	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	FMP32	P43557	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	HOL1	P53389	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	IBD2	P53892	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	KRE28	Q04431	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	FAR10	Q06001	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TRX3	P25372	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SSH4	P32343	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PET127	P32606	800 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	CBP4	P37267	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YBR139W	P38109	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	ICE2	P40499	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RPA14	P50106	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	MPS1	P54199	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RMI1	Q02685	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	TAF11	Q04226	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RIF2	Q06208	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	APC9	Q12107	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	ZIP1	P31111	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	FUN30	P31380	1131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YEL020C	P39994	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	FMP52	P40008	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	HPM1	P40481	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
NDC1	YML031W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	APC4	Q04601	652 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SPC2	Q04969	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PDR8	Q06149	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	NDL1	Q06568	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	REX4	Q08237	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	NTO1	Q12311	748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	AI1	P03875	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SPT3	P06844	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	CLB2	P24869	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
NDC1	YML031W	YCL042W	P25572	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	PHA2	P32452	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SPC42	P36094	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	FES1	P38260	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	DSS1	P39112	969 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SHE4	P51534	789 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RSM24	Q03976	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	RAD30	Q04049	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NDC1	YML031W	SMP3	Q04174	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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