RNA–Protein interactions for RNA: YLR345W

YLR345W, Transcript of Similar to 6-phosphofructo-2-kinase enzymes, yeast

Gene YLR345W, Length 1,530 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR345W	YLR345W	YGR149W	P48236	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SKO1	Q02100	647 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ECM18	Q04623	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	AEP3	Q12089	606 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	MRPL25	P23369	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	PRD1	P25375	712 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YBL028C	P38202	106 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	KRE9	P39005	276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	EFM3	P47163	339 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YGL138C	P53122	345 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YNL143C	P53908	130 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	VPS20	Q04272	221 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RTT103	Q05543	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	GLO2	Q05584	274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RRT8	Q08219	342 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SUC2	P00724	532 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SPO7	P18410	259 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	FRE1	P32791	686 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	THI2	P38141	450 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	MSR1	P38714	643 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SSO2	P39926	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	CSM2	P40465	213 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YJL132W	P47014	750 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	PRM1	P53835	661 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	THP1	Q08231	455 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YRM1	Q12340	786 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RAD61	Q99359	647 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	HMX1	P32339	317 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	TUL1	P36096	758 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ELP2	P42935	788 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	COS5	P47187	383 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	FMS1	P50264	508 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SLD5	Q03406	294 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ACL4	Q03771	387 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	BNA5	Q05979	453 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	COS7	Q07788	383 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	VPS3	P23643	1011 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	PET18	P25362	215 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RDS1	P25611	832 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YCR022C	P25620	114 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	NDC1	P32500	655 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	MSN2	P33748	704 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	PEX18	P38855	283 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	MLH1	P38920	769 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RPR2	P40571	144 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	RTT101	P47050	842 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YGL082W	P53155	381 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	PTR2	P32901	601 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SHP1	P34223	423 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	BNA4	P38169	460 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	PFF1	P38244	976 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SER3	P40054	469 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YFR018C	P43599	363 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	GIM3	P53900	129 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SYO1	Q07395	620 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	COR1	P07256	457 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	CLN1	P20437	546 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLR345W	YLR345W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms