RNA–Protein interactions for RNA: YLR187W

SKG3, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SKG3, Length 3,081 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG3	YLR187W	HSE1	P38753	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SAP4	P53036	818 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	ARR1	Q06596	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RAD34	Q06665	692 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	GSH2	Q08220	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SVS1	Q12254	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RPN6	Q12377	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MPD2	Q99316	277 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	LYP1	P32487	611 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	COG3	P40094	801 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	ALG8	P40351	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	STE24	P47154	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YNL034W	P53963	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RCF1	Q03713	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	ACF2	Q12168	779 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	DST1	P07273	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	CDC5	P32562	705 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	ARA1	P38115	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RGI2	P40188	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	IRC6	P43615	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MET12	P46151	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	PRM8	P53174	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	CAF120	P53836	1060 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	EAF1	Q06337	982 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	NPR1	P22211	790 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MRPL8	P22353	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	HIR2	P32480	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YKR051W	P36142	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RCK1	P38622	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	EFM1	P38732	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RPH1	P39956	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	EMP65	P40085	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
SKG3	YLR187W	SSY5	P47002	699 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	GLG2	P47011	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SPC105	P53148	917 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MKC7	P53379	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	IRC15	Q02733	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SOL2	P37262	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SLX1	P38324	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YHR202W	P38887	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	AFG3	P39925	761 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YNR040W	P53736	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	GRS2	Q06817	618 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	HSP42	Q12329	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YPR1	Q12458	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	TIM9	O74700	87 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	ALG7	P07286	448 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	DCC1	P25559	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	PEX34	P25584	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MKK2	P32491	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SDH3	P33421	198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MUM2	P38236	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YBR071W	P38243	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	UBA4	P38820	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YKE4	P40544	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MEP2	P41948	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	BUD7	Q08754	746 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RBD2	Q12270	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	STT4	P37297	1900 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
SKG3	YLR187W	TIP20	P33891	701 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	AMA1	P50082	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	YML108W	Q03759	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	VHS1	Q03785	461 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	VTA1	Q06263	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	PHO92	Q06390	306 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SYO1	Q07395	620 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SKG3	YLR187W	RTN2	Q12443	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.4 ms