RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	MRPL40	P36534	297 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	GRX7	P38068	203 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	DTR1	P38125	572 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	ATG12	P38316	186 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RCK2	P38623	610 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	ASG7	P46993	209 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	GWT1	P47026	490 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	YJR030C	P47101	745 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	COG6	P53959	839 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	DOS2	P54858	310 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	PIR3	Q03180	325 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	IOC4	Q04213	475 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RTT109	Q07794	436 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RKM5	Q12367	367 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	SKM1	Q12469	655 aa		1.04	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	CHS1	P08004	1131 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	NUC1	P08466	329 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	PPH22	P23595	377 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	YCR007C	P25354	239 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	PRD1	P25375	712 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RPC53	P25441	422 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	ATG15	P25641	520 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RAD16	P31244	790 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RML2	P32611	393 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	PXA2	P34230	853 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	NAT2	P37293	288 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	MRPS9	P38120	278 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	TSC10	P38342	320 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	GPI16	P38875	610 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	SMF1	P38925	575 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	ELO1	P39540	310 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RSM25	P40496	264 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	UFE1	P41834	346 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	BIR1	P47134	954 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	FLC3	P53121	802 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	DUG3	P53871	357 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.03	□□□□□ -2.24	not detected
PAM16	YJL104W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	SWS2	P53937	143 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	DIA1	P54005	336 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	SLG1	P54867	378 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	HER2	Q03557	464 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	TRM82	Q03774	444 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	YET2	Q04210	160 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	YML096W	Q04489	525 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	PRM6	Q04705	352 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	YLH47	Q06493	454 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	SUE1	Q06524	206 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	PDR18	P53756	1333 aa		1.03	□□□□□ -2.24
PAM16	YJL104W	PEP5	P12868	1029 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CLC1	P17891	233 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	DPH2	P32461	534 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SOL2	P37262	315 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	PFS1	P38872	237 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YJR079W	P47126	109 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MLC1	P53141	149 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	IBD2	P53892	351 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	AQR1	P53943	586 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SHR3	Q02774	210 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YPL113C	Q02961	396 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YDR541C	Q03049	344 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	CSM3	Q04659	317 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	AIM32	Q04689	311 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	YDL057W	Q07379	328 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SHS1	Q07657	551 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TMA16	Q08687	178 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	COX17	Q12287	69 aa		1.02	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SUC2	P00724	532 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	COQ1	P18900	473 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ANP1	P32629	500 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	KDX1	P36005	433 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	RSM22	P36056	628 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	ARA1	P38115	344 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MRX3	P38172	270 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	MMS4	P38257	691 aa		1.01	□□□□□ -2.25
PAM16	YJL104W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms