RNA–Protein interactions for RNA: YHR178W

STB5, Transcript of Transcription factor, yeast

Gene STB5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB5	YHR178W	YFL052W	P43551	465 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	HMS2	P47175	358 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	PET117	Q02771	107 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	ARA2	Q04212	335 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MFG1	Q07684	458 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	PLB3	Q08108	686 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RRT8	Q08219	342 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YPL199C	Q08954	240 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MED4	Q12343	284 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YDL199C	Q12407	687 aa		5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	CDC4	P07834	779 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MET2	P08465	486 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	APE1	P14904	514 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	ACP1	P32463	125 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	ARP1	P38696	384 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	GEM1	P39722	662 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RFC2	P40348	353 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YIL077C	P40508	320 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	ECM27	P47144	725 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	BOL2	P53082	120 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	KTR6	P54070	446 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	BNA7	Q04066	261 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	BLS1	Q06071	122 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SWC7	Q06707	132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SNF8	Q12483	233 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		5.81	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SPS2	P08459	502 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SAM35	P14693	329 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	COQ2	P32378	372 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MRP21	P38175	177 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YHR202W	P38887	602 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SLX8	P40072	274 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	LSB6	P42951	607 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TIS11	P47977	285 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	IMO32	P53219	342 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.8	□□□□□ -1.48	not detected
STB5	YHR178W	PLB2	Q03674	706 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YML020W	Q03722	664 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	NNT1	Q05874	261 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	BMT6	Q12291	365 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YOS9	Q99220	542 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MOD5	P07884	428 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	APA2	P22108	325 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	PGS1	P25578	521 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	NDC1	P32500	655 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SCD5	P34758	872 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SDS22	P36047	338 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	VPS51	P36116	164 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TVP38	P36164	337 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SBE22	P38814	852 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	HAT2	P39984	401 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	AYR1	P40471	297 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MAD2	P40958	196 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	GAB1	P41733	394 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RET2	P43621	546 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	SCY1	P53009	804 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	IGO1	P53897	168 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RRN5	Q02983	363 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	AIM36	Q03798	255 aa		5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	CTS1	P29029	562 aa		5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	COX13	P32799	129 aa		5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	MRPL40	P36534	297 aa		5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	RRF1	P38771	230 aa		5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	YEL028W	P39989	153 aa		5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	PFD1	P46988	109 aa		5.79	□□□□□ -1.48
STB5	YHR178W	TIM13	P53299	105 aa		5.79	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.3 ms