RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W SHO1P40073 367 aa3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W SYG1P40528 902 aa3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W YGL108CP53139 140 aa3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W MDM1Q01846 1127 aa3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W IRC15Q02733 499 aa3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W CSM3Q04659 317 aa3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RQC1Q05468 723 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W VPS74Q06385 345 aa3.38□□□□□ -1.87
THP2YHR167W VPS1P21576 704 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W MAK31P23059 88 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RNA14P25298 677 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W BUB3P26449 341 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RGT1P32862 1170 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W EBP2P36049 427 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W FAU1P40099 211 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W HXT14P42833 540 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W GWT1P47026 490 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W LSB1P53281 241 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W BNI5P53890 448 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W ARK1P53974 638 aa3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W BRR1Q99177 341 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
THP2YHR167W ILV1P00927 576 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W ATR1P13090 542 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W EXO70P19658 623 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RDS1P25611 832 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W ERG3P32353 365 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W MFT1P33441 392 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W YHR218WP38899 603 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W SPT8P38915 602 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W ALG8P40351 577 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data3.36□□□□□ -1.87not detected
THP2YHR167W RTN2Q12443 393 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W CTF3Q12748 733 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W YOL159C-AQ3E769 90 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W YLR278CQ05854 1341 aa3.36□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RIM15P43565 1770 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W MATALPHA2P0CY08 210 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W HMLALPHA2P0CY09 210 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RED1P14291 827 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W FRS2P15625 503 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W VMA2P16140 517 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W SPB1P25582 841 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RXT2P38255 430 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RSM25P40496 264 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W YIL089WP40500 205 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W FMS1P50264 508 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W AIM33Q04516 312 aa3.35□□□□□ -1.87
THP2YHR167W PMD1P32634 1753 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W INH1P01097 85 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W FUN19P28003 413 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W HXT3P32466 567 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W BMH2P34730 273 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W MYO3P36006 1272 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W TUL1P36096 758 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W OPY1P38271 328 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W PES4P39684 611 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W VAB2P40003 282 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W POP1P41812 875 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W GCD10P41814 478 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W ELP2P42935 788 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RSC1P53236 928 aa3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
THP2YHR167W THR4P16120 514 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CLC1P17891 233 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W ATP10P18496 279 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CPR3P25719 182 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RAD14P28519 371 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W MSP1P28737 362 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W AFG1P32317 509 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W IME2P32581 645 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W THI2P38141 450 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PCA1P38360 1216 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W TIF5P38431 405 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W URB2P47108 1174 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YGR149WP48236 432 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W WSC2P53832 503 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PGA2P53903 129 aa3.33□□□□□ -1.88
THP2YHR167W CDC37P06101 506 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RHO2P06781 192 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W YIM1P28625 365 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W NPL6P32832 435 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W FRE2P36033 711 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W IDP2P41939 412 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RRT5P43607 289 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SRB7P47822 140 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W HST1P53685 503 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W BOR1P53838 576 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W RTC4P53850 401 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SMC6Q12749 1114 aa3.32□□□□□ -1.88
THP2YHR167W HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W LEU4P06208 619 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W SPS4P09937 338 aa3.31□□□□□ -1.88
THP2YHR167W PPH22P23595 377 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25 ms