RNA–Protein interactions for RNA: YDR346C

SVF1, Transcript of Protein with a potential role in cell survival pathways, yeast

Gene SVF1, Length 1,446 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVF1	YDR346C	CYB2	P00175	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	NIP100	P33420	868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	SSU1	P41930	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	COS10	P52924	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	WSC2	P53832	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	ARK1	P53974	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	ISN1	Q99312	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	LYS2	P07702	1392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	RPC53	P25441	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	SOV1	Q04748	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	PPT2	Q12036	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	CTF3	Q12748	733 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	PHO2	P07269	559 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	YCR051W	P25631	222 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	STB6	P36085	766 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	VHC1	P38329	1120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	GCD10	P41814	478 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	AVT4	P50944	713 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	PCP1	P53259	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	PIR3	Q03180	325 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	ROY1	Q04847	553 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SVF1	YDR346C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ATR1	P13090	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	RTT103	Q05543	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	USO1	P25386	1790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	APC1	P53886	1748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	RIP1	P08067	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YCR100C	P25606	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ADK2	P26364	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	NDI1	P32340	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	REC114	P32841	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YME2	P32843	850 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	MRPL10	P36520	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ARA1	P38115	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	TRS85	P46944	698 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	AFI1	Q99222	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	PDX1	P16451	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	REC107	P21651	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	GYP6	P32806	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YCR041W	P37265	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	FMS1	P50264	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	DSL1	P53847	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	HSP31	Q04432	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	SNT1	P25357	1226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	LTV1	P34078	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YGL138C	P53122	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	SAS2	P40963	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	RRT5	P43607	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	POP6	P53218	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	PNG1	Q02890	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	SEC63	P14906	663 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YHR218W	P38899	603 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	COS5	P47187	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	YIP1	P53039	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	VPS60	Q03390	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	COS7	Q07788	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	VAM3	Q12241	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	NCB2	Q92317	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ERV1	P27882	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	BEM1	P29366	551 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	ODC1	Q03028	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	MDM30	Q05930	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SVF1	YDR346C	CHS1	P08004	1131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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