RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YSW1	P38280	609 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	HSM3	P38348	480 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	DSN1	P40568	576 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	POP1	P41812	875 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SNO3	P43544	222 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	VPS25	P47142	202 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RTC4	P53850	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	MDM36	Q06820	579 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	POS5	Q06892	414 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RRI1	Q12468	440 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ARP6	Q12509	438 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SRN2	Q99176	213 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	POM152	P39685	1337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SCEI	P03882	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PMR1	P13586	950 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	BEM1	P29366	551 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	NDI1	P32340	513 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	VRG4	P40107	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YIL089W	P40500	205 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YIL060W	P40519	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	TAX4	P47030	604 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RHO4	Q00246	291 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RRN11	Q04712	507 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ECI1	Q05871	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ARR2	Q06597	130 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	MSN2	P33748	704 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	FAD1	P38913	306 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SPT8	P38915	602 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	MLH1	P38920	769 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PET100	P38958	111 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	IAH1	P41734	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	FET5	P43561	622 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	NMD5	P46970	1048 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ALF1	P53904	254 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	VPS20	Q04272	221 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	HSP31	Q04432	237 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	MLH2	Q07980	695 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PSY3	Q12318	242 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SUC2	P00724	532 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	EXO70	P19658	623 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YCR007C	P25354	239 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RHB1	P25378	209 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	GEX1	P25596	615 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	NTG1	P31378	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	UTR4	P32626	227 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	MIC60	P36112	540 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RRN10	P38204	145 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	SLX1	P38324	304 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RFC3	P38629	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	HXT9	P40885	567 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YGL082W	P53155	381 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	HST1	P53685	503 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	NNT1	Q05874	261 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RSF2	P46974	1380 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YPR089W	O13585	888 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	KSS1	P14681	368 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	GID7	P25569	745 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ATP11	P32453	318 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	RIB7	P33312	244 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	MRPL40	P36534	297 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	PFF1	P38244	976 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NUS1	YDL193W	YHR131C	P38835	850 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms