RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B HXT4P32467 576 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B MKS1P34072 584 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ADE17P38009 592 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YBR220CP38318 560 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B MGE1P38523 228 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SMF2P38778 549 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B HXT6P39003 570 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B HXT7P39004 570 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PZF1P39933 429 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B AST2P39945 430 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B REE1P40893 198 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SLS1P42900 643 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ALB1P47019 175 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B MSY1P48527 492 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ATP22P50273 684 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B MDM34P53083 459 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PEX8P53248 589 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B COG6P53959 839 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B NGL3Q03210 505 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS71Q03433 280 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RIF2Q06208 395 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RSC58Q07979 502 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RDR1Q08904 546 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PSY3Q12318 242 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ICT1Q12385 394 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B MDM12Q92328 271 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B TAD3Q9URQ3 322 aa2.87□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ERR1P0CX10 437 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ERR2P0CX11 437 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B DAT1P13483 248 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ELO2P25358 347 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YCL068CP25593 260 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B IDH2P28241 369 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ELM1P32801 640 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B TOM20P35180 183 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SNU114P36048 1008 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PSY4P38193 441 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RCK2P38623 610 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B EFM1P38732 585 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B CKB2P38930 258 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ARG2P40360 574 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B MAD2P40958 196 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ERR3P42222 437 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YFL012WP43580 148 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B KEL2P50090 882 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B NHX1Q04121 633 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YLR036CQ07986 203 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B REX4Q08237 289 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ESA1Q08649 445 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PUS9Q12069 462 aa2.86□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B STE2D6VTK4 431 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SEC53P07283 254 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.85□□□□□ -1.95not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B SEC14P24280 304 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B TRX3P25372 127 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SPB1P25582 841 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B DAL80P26343 269 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B VMA11P32842 164 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B KES1P35844 434 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B BNA4P38169 460 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B HSM3P38348 480 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B FLO5P38894 1075 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ALG5P40350 334 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YIL165CP40446 119 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B AYR1P40471 297 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B CAB2P40506 365 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SHR5P41912 237 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B IDP2P41939 412 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YFL064CP43540 174 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YDL186WP48568 277 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SBH2P52871 88 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SOK2P53438 785 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B BOP3P53958 396 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B UME1Q03010 460 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RSM28Q03430 361 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR111CQ04461 462 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PDR8Q06149 701 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B TMA16Q08687 178 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B UIP4Q08926 304 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR202WQ08993 238 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RUP1Q12242 671 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RIB2Q12362 591 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B SKS1Q12505 502 aa2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B NOP14Q99207 810 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B COX6P00427 148 aa2.84□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B STE3P06783 470 aa2.84□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B PET111P08468 800 aa2.84□□□□□ -1.95
tC(GCA)BtC(GCA)B RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
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