RNA–Protein interactions for RNA: YOR348C

PUT4, Transcript of Proline permease, yeast

Gene PUT4, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT4	YOR348C	YFL066C	P43538	392 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	MDM34	P53083	459 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	VPS74	Q06385	345 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	GRS2	Q06817	618 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RGT2	Q12300	763 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	AI3	P03877	415 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	PMT4	P46971	762 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	IGO1	P53897	168 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
PUT4	YOR348C	PEX34	P25584	144 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MAC1	P35192	417 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	EMC3	P36039	253 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YBR071W	P38243	211 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	JLP2	P40206	208 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YJR149W	P47177	404 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	AAT1	Q01802	451 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MDM36	Q06820	579 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MED2	Q12124	431 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	CLN2	P20438	545 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	EPT1	P22140	391 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	HXT4	P32467	576 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	INM1	P38710	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	HXT7	P39004	570 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YEL073C	P39974	107 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SOK1	P40317	901 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MUP1	P50276	574 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	VEL1	P53058	206 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	GSH2	Q08220	491 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	GIP3	Q03016	1276 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	NSI1	Q12457	570 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	HCS1	P34243	683 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	ARN2	P38724	620 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SPO73	P40031	143 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MPS2	P53159	387 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	GOR1	P53839	350 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YLR345W	Q06137	509 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RCN2	Q12044	265 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SWI5	P08153	709 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SEA4	P38164	1038 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SWC4	P53201	476 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SPO23	P33757	523 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YHR033W	P38690	423 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	JHD1	P40034	492 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	FMP10	P40098	244 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YNL181W	P53878	407 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	NEJ1	Q06148	342 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	VPS13	Q07878	3144 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YPR096C	O13587	100 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	GCN3	P14741	305 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	PXA2	P34230	853 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	NMD4	Q12129	218 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	NFT1	P0CE68	1218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	HMG2	P12684	1045 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RER1	P25560	188 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	GSH1	P32477	678 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YHR112C	P38716	378 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	IRC6	P43615	237 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MET12	P46151	657 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YJL043W	P47053	257 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	CCE1	Q03702	353 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	URC2	Q04411	772 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	BRE4	Q07660	1125 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	RRT8	Q08219	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	REV1	P12689	985 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	TRX3	P25372	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	CBP4	P37267	147 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SSU1	P41930	458 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	ALR2	P43553	858 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	NUP49	Q02199	472 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	SMA1	Q02651	245 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	HEH2	Q03281	663 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PUT4	YOR348C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23

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