RNA–Protein interactions for RNA: YNL296W

YNL296W, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL296W, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL296W	YNL296W	END3	P39013	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	MNN1	P39106	762 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YGR079W	P53249	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	CLD1	P53264	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	GAS2	Q06135	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	ESA1	Q08649	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YNL296W	YNL296W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL296W	YNL296W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YNL296W	YNL296W	VMA3	P25515	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	URA10	P30402	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RRN3	P36070	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	TUL1	P36096	758 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RCK2	P38623	610 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	PKP1	P40530	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YNL296W	YNL296W	SDT1	P53078	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	BOL2	P53082	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	BTN2	P53286	410 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	NHP10	Q03435	203 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SOV1	Q04748	898 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	FLO9	P39712	1322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	NPR1	P22211	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	HXT4	P32467	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RPN12	P32496	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SDH3	P33421	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	LOT5	P34234	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	HXT7	P39004	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	EMP65	P40085	556 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YGR067C	P53243	804 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	PFA5	Q03289	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	GAS3	Q03655	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	APC4	Q04601	652 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SFG1	Q12507	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	MDM12	Q92328	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	MTR10	Q99189	972 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YOS9	Q99220	542 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	MET2	P08465	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	STP22	P25604	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YHI9	P38765	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	CAB2	P40506	365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	CIN1	P40987	1014 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YFL012W	P43580	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	STE24	P47154	453 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	REX4	Q08237	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	MED7	Q08278	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	DAP2	P18962	818 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	VPS33	P20795	691 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	ATS1	P31386	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	HXT1	P32465	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	POP4	P38336	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	HSM3	P38348	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	APS3	P47064	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SPO20	Q04359	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	CDC123	Q05791	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RSC2	Q06488	889 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RUP1	Q12242	671 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	TRX3	P25372	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YNL296W	YNL296W	CWH43	P25618	953 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms