RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	TRS85	P46944	698 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YJL132W	P47014	750 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ECM27	P47144	725 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YIP1	P53039	248 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	SKO1	Q02100	647 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	YDR131C	Q03899	556 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ISA2	Q12425	185 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ISN1	Q99312	450 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YNL171C	YNL171C	ECM25	P32525	599 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MRP4	P32902	394 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SDS24	P38314	527 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YHR218W	P38899	603 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SAS2	P40963	338 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	RMT2	Q03305	412 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MUM3	Q08750	479 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YPL199C	Q08954	240 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	HIP1	P06775	603 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SNT1	P25357	1226 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	RHB1	P25378	209 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	CPR3	P25719	182 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	BEM1	P29366	551 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SIN4	P32259	974 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	HIR2	P32480	875 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	PIM1	P36775	1133 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MMS4	P38257	691 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YFL067W	P43537	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	RRT5	P43607	289 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	HNT3	Q08702	217 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SEC63	P14906	663 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	CLB1	P24868	471 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	KRE2	P27809	442 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	NAT2	P37293	288 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SSN8	P47821	323 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MRP51	Q02950	344 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	URA4	P20051	364 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	ERV1	P27882	189 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	PCA1	P38360	1216 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	RFC3	P38629	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YMR130W	Q04223	302 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MDM30	Q05930	598 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	REX4	Q08237	289 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	PMR1	P13586	950 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	BRF1	P29056	596 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.73	□□□□□ -1.81	not detected
YNL171C	YNL171C	ZIM17	P42844	174 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	LAM5	P43560	674 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	HMS2	P47175	358 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	FRE4	P53746	719 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	GOR1	P53839	350 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	HOT1	Q03213	719 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	TIM18	Q08749	192 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SMC6	Q12749	1114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	CHS1	P08004	1131 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	HEM15	P16622	393 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	PXA2	P34230	853 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	MST28	P39552	234 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	IBD2	P53892	351 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	ACL4	Q03771	387 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	AIM32	Q04689	311 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	YLR345W	Q06137	509 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	VPS54	Q12071	889 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YNL171C	YNL171C	SCEI	P03882	235 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	CLN1	P20437	546 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	CPR2	P23285	205 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RIB5	P38145	238 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SLM4	P38247	162 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	RRT2	P38332	387 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	BOR1	P53838	576 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	DCS1	Q06151	350 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SOR2	Q07786	357 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	SGT1	Q08446	395 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	MED2	Q12124	431 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YNL171C	YNL171C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.71	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23 ms