RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	DSE3	Q08729	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	NFI1	Q12216	726 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RUP1	Q12242	671 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	COX3	P00420	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PMR1	P13586	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
RPS31	YLR167W	ECM25	P32525	599 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	TOA1	P32773	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	UIP5	P36137	443 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RRN10	P38204	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	FAD1	P38913	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	MLH1	P38920	769 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	TRS85	P46944	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RBA50	Q04418	439 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	VPS74	Q06385	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SOR2	Q07786	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SPC110	P32380	944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PCA1	P38360	1216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	TOF1	P53840	1238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SEC5	P89102	971 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	IRC15	Q02733	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PPM1	Q04081	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	NRT1	Q08485	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	GLN3	P18494	730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	ATO2	P32907	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YSW1	P38280	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	VPS52	P39904	641 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	AZF1	P41696	914 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PHO86	P46956	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	MRPL4	P36517	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	WSS1	P38838	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	STN1	P38960	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YAL037W	P39728	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	GAT2	P40209	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YPS6	P40583	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PNG1	Q02890	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YFH1	Q07540	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	DAP2	P18962	818 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	CTR86	P25355	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	SIF2	P38262	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	ELP2	P42935	788 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPS31	YLR167W	PDE2	P06776	526 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	ALG1	P16661	449 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	YEL043W	P32618	956 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	PFF1	P38244	976 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	EPL1	P43572	832 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	GWT1	P47026	490 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	YIP1	P53039	248 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	MEH1	Q02205	184 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	URH1	Q04179	340 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	NSE1	Q07913	336 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	SGT1	Q08446	395 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	FRE2	P36033	711 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	RSM22	P36056	628 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	CHS6	P40955	746 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	PCP1	P53259	346 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	FMP42	Q04991	504 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	GEP3	Q08622	556 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	ATG34	Q12292	412 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	SRN2	Q99176	213 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPS31	YLR167W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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