RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	SSN8	P47821	323 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	GOR1	P53839	350 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	PBA1	Q05778	276 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	YLR287C	Q05881	355 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	ERV2	Q12284	196 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	RIP1	P08067	215 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	REV1	P12689	985 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	CLB3	P24870	427 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	ECM25	P32525	599 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	SAS3	P34218	831 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	MIX23	P38162	196 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	ECM27	P47144	725 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	FMS1	P50264	508 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	SMA2	Q04658	369 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	SIL1	Q08199	421 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	YLR108C	Q12259	485 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	CLC1	P17891	233 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	CPR4	P25334	318 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	NAM9	P27929	486 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	NPL6	P32832	435 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	MST28	P39552	234 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	SFI1	Q12369	946 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YCT1	YLL055W	SPS22	P25380	463 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RML2	P32611	393 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	NFU1	P32860	256 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SDH3	P33421	198 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	ARA1	P38115	344 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RIB5	P38145	238 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SAS2	P40963	338 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	LAM5	P43560	674 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	BTN2	P53286	410 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	TIM18	Q08749	192 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SCM3	Q12334	223 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SEC63	P14906	663 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	TOA1	P32773	286 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	STB6	P36085	766 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YHR054C	P38780	354 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YGR210C	P42942	411 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	TOF1	P53840	1238 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RAD61	Q99359	647 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PEX5	P35056	612 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.82	□□□□□ -1.96	RIP-Chip
YCT1	YLL055W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SHE10	P53075	577 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	FRE4	P53746	719 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	TMS1	Q12116	473 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	HSP42	Q12329	375 aa		2.82	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	LDB16	P25587	256 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SIN4	P32259	974 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RFC3	P38629	340 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	FAA2	P39518	744 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	REE1	P40893	198 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YMR181C	Q03231	154 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YMR155W	Q03795	547 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SGT1	Q08446	395 aa		2.81	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	KRE2	P27809	442 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	ITR1	P30605	584 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YEL045C	P32616	141 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PRM5	P40476	318 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	NCA3	P46955	337 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	COS5	P47187	383 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YGL138C	P53122	345 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	YNR048W	P53740	393 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	HXT11	P54862	567 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	MRPL35	Q06678	367 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	COS7	Q07788	383 aa		2.8	□□□□□ -1.96
YCT1	YLL055W	REX4	Q08237	289 aa		2.8	□□□□□ -1.96

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