RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL047W	YLL047W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	CHS1	P08004	1131 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	CLB3	P24870	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YCR041W	P37265	110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	HSP42	Q12329	375 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	RAD61	Q99359	647 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	HCS1	P34243	683 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	PIM1	P36775	1133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	MDG1	P53885	366 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	SEC63	P14906	663 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YIM1	P28625	365 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	STB6	P36085	766 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	VHC1	P38329	1120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YHR054C	P38780	354 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YIL067C	P40514	678 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	CPR4	P25334	318 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	SNT1	P25357	1226 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	KRE2	P27809	442 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	NAM9	P27929	486 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	ARA1	P38115	344 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	RFC3	P38629	340 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	NDT80	P38830	627 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	PCP1	P53259	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YNR048W	P53740	393 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	TIM18	Q08749	192 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	INH1	P01097	85 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	PPH22	P23595	377 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	LDB16	P25587	256 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	SIN4	P32259	974 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	JNM1	P36224	373 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	HER2	Q03557	464 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YLL047W	YLL047W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	RML2	P32611	393 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	FAA2	P39518	744 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	LAM5	P43560	674 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SDT1	P53078	280 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	TOF1	P53840	1238 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	TMS1	Q12116	473 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	RIB5	P38145	238 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SAS2	P40963	338 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	COS5	P47187	383 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	COS7	Q07788	383 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	REC107	P21651	314 aa		4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	GEX1	P25596	615 aa		4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	YEL045C	P32616	141 aa		4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
YLL047W	YLL047W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	PRM5	P40476	318 aa		4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	TAF12	Q03761	539 aa		4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	VAM3	Q12241	283 aa		4	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	LSB5	P25369	354 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SAS3	P34218	831 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	MRPL4	P36517	319 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	MTC6	P38849	526 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	GOR1	P53839	350 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SKO1	Q02100	647 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SIL1	Q08199	421 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	REX4	Q08237	289 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SCEI	P03882	235 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	SPR1	P32603	445 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	YME2	P32843	850 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YLL047W	YLL047W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 707.7 ms