RNA–Protein interactions for RNA: YKR062W

TFA2, Transcript of TFIIE small subunit, yeast

Gene TFA2, Length 987 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TFA2	YKR062W	BEM1	P29366	551 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	RGT1	P32862	1170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	LAM5	P43560	674 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	SCW10	Q04951	389 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	VAM3	Q12241	283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	HIP1	P06775	603 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	RIP1	P08067	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	KRE9	P39005	276 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	SKO1	Q02100	647 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	ROY1	Q04847	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	SGT1	Q08446	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	HNT3	Q08702	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	MED2	Q12124	431 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TFA2	YKR062W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	CBS2	P14905	389 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	PDX1	P16451	410 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	URA4	P20051	364 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RHB1	P25378	209 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	PXA2	P34230	853 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	GCD10	P41814	478 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	HMS2	P47175	358 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RRN11	Q04712	507 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	CLN1	P20437	546 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	SPS22	P25380	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RPC53	P25441	422 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	KRE2	P27809	442 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	BRF1	P29056	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	PCA1	P38360	1216 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	GOR1	P53839	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	ESA1	Q08649	445 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	TIM18	Q08749	192 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	HOM3	P10869	527 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	HEM15	P16622	393 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	CLB1	P24868	471 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	HIR2	P32480	875 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RIB5	P38145	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	NDT80	P38830	627 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
TFA2	YKR062W	FRE4	P53746	719 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	MDG1	P53885	366 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	HOT1	Q03213	719 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	VPS54	Q12071	889 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YLL056C	Q12177	298 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	ADK2	P26364	225 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	SIN4	P32259	974 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
TFA2	YKR062W	YBL059W	P34224	193 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	SAS2	P40963	338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RRT5	P43607	289 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	TRS85	P46944	698 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	DCS1	Q06151	350 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	PMR1	P13586	950 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	PIM1	P36775	1133 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	MST28	P39552	234 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	NCA3	P46955	337 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YGL242C	P53066	181 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	BET5	Q03630	159 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RRD2	Q12461	358 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	RRN10	P38204	145 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	MTC6	P38849	526 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	YIL067C	P40514	678 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	ZIM17	P42844	174 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	ARK1	P53974	638 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	SMA2	Q04658	369 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	PBA1	Q05778	276 aa		4.03	□□□□□ -1.76
TFA2	YKR062W	SCEI	P03882	235 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TFA2	YKR062W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
TFA2	YKR062W	LSB5	P25369	354 aa		4.02	□□□□□ -1.77
TFA2	YKR062W	SDH3	P33421	198 aa		4.02	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms