RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W

DSE2, Transcript of Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, yeast

Gene DSE2, Length 978 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE2	YHR143W	YGL138C	P53122	345 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YGL108C	P53139	140 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YGR016W	P53209	190 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	BOR1	P53838	576 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SKO1	Q02100	647 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	PEX25	Q02969	394 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	GYL1	Q04322	720 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	COS7	Q07788	383 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	TLG2	Q08144	397 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	CTF3	Q12748	733 aa		3.01	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	CBS2	P14905	389 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	BUB3	P26449	341 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YIM1	P28625	365 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	GYP6	P32806	458 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SLM4	P38247	162 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YGR149W	P48236	432 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	HOT1	Q03213	719 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	MED2	Q12124	431 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	GPM3	Q12326	303 aa		3	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	PMR1	P13586	950 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	AFG1	P32317	509 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	ANP1	P32629	500 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	ARA1	P38115	344 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SYG1	P40528	902 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YGR111W	P53265	400 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SIL1	Q08199	421 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	HNT3	Q08702	217 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YLL056C	Q12177	298 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RKM5	Q12367	367 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	HIP1	P06775	603 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	CLN1	P20437	546 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	DPH2	P32461	534 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SWH1	P35845	1188 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RSM22	P36056	628 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	CBP4	P37267	147 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	AVT5	P38176	459 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	PCA1	P38360	1216 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YHR054C	P38780	354 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	POP1	P41812	875 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	TOM22	P49334	152 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	ACL4	Q03771	387 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	MMR1	Q06324	491 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
DSE2	YHR143W	VAM3	Q12241	283 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	HSP42	Q12329	375 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SKS1	Q12505	502 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RIP1	P08067	215 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	URA4	P20051	364 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	KRE2	P27809	442 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	FRE2	P36033	711 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	HEL1	P36113	551 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YBR139W	P38109	508 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	EFM4	P40516	257 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	GCD10	P41814	478 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YPI1	P43587	155 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	CAF40	P53829	373 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	ARK1	P53974	638 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	YMR130W	Q04223	302 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	DCI1	Q08558	271 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	RRD2	Q12461	358 aa		2.97	□□□□□ -1.93
DSE2	YHR143W	SPO7	P18410	259 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	BRF1	P29056	596 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	NDI1	P32340	513 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	HIR2	P32480	875 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	TOA1	P32773	286 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	REC114	P32841	428 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	MMS4	P38257	691 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	RRT5	P43607	289 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	ECM27	P47144	725 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	BTN2	P53286	410 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	EOS1	P53938	366 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	PIR3	Q03180	325 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	DCS1	Q06151	350 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	UAF30	Q08747	228 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	RSA1	Q08932	381 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	PGC1	Q08959	321 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	VPS54	Q12071	889 aa		2.96	□□□□□ -1.94
DSE2	YHR143W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94

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