RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	STE3	P06783	470 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	REC107	P21651	314 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CDC20	P26309	610 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	URA10	P30402	227 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	OAR1	P35731	278 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RSM22	P36056	628 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	APT2	P36973	181 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YHI9	P38765	294 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SPC97	P38863	823 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	FMP52	P40008	231 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	APQ12	P40532	138 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	DJP1	P40564	432 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CEP3	P40969	608 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TIS11	P47977	285 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SPT20	P50875	604 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ROG1	P53118	685 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ALF1	P53904	254 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BCH1	Q05029	724 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BOP2	Q06150	570 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YLR352W	Q06479	807 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RSC58	Q07979	502 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	REX3	Q12090	404 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	COR1	P07256	457 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CDC5	P32562	705 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MSG5	P38590	489 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	FRT2	P39734	528 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	PAC11	P40960	533 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	STB2	P46679	850 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MAL11	P53048	616 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YPL109C	Q02981	657 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	HDA2	Q06629	674 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ATG23	Q06671	453 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	WHI5	Q12416	295 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SRN2	Q99176	213 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BLM10	P43583	2143 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	HMG1	P12683	1054 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	STP22	P25604	385 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MGT1	P26188	188 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ZIP1	P31111	875 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	HXT4	P32467	576 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SDH3	P33421	198 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MRPL10	P36520	322 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	POP4	P38336	279 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	HXT7	P39004	570 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SNO3	P43544	222 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MET12	P46151	657 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BOL2	P53082	120 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CLD1	P53264	445 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ALG12	P53730	551 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	TDA9	Q04545	1251 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	VPS38	Q05919	439 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	APL4	Q12028	832 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	PUS9	Q12069	462 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MLS1	P30952	554 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YKL100C	P34248	587 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ALG3	P38179	458 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YBR062C	P38239	180 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CCZ1	P38273	704 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ZRG8	P40021	1076 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	EFM4	P40516	257 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	PRM2	P40534	656 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MAD2	P40958	196 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ECO1	P43605	281 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YNL260C	P53846	198 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	BOP3	P53958	396 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	VPS16	Q03308	798 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	CDC123	Q05791	360 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	MCH5	Q08777	521 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YOR352W	Q08816	343 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	YPR011C	Q12251	326 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SYF2	YGR129W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	MAK32	P23060	363 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.39	□□□□□ -1.55	not detected
SYF2	YGR129W	APE4	P38821	490 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	EMP65	P40085	556 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	GOT1	Q03554	138 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SYF2	YGR129W	SPO20	Q04359	397 aa		5.39	□□□□□ -1.55

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