RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W PCL6P40038 420 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ATM1P40416 690 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W COS4P43542 379 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MPS3P47069 682 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W COS5P47187 383 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ASK10P48361 1146 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PAC10P48363 199 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W APT1P49435 187 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPL4BP49626 362 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YGR237CP50089 785 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SEH1P53011 349 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VOA1P53262 265 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W COS1P53822 381 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YPL107WQ02873 248 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PEX25Q02969 394 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RMT2Q03305 412 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RSN1Q03516 953 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VHS1Q03785 461 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CSI1Q04368 295 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FAR10Q06001 478 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SPH1Q06160 661 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YLR173WQ06247 608 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YOL019WQ08157 551 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GIS3Q12418 502 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W KRE5P22023 1365 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W USO1P25386 1790 aa3.35□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TY1B-BRQ12193 1756 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TY1B-GR3Q12316 1755 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TY1B-ORQ92393 1755 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CAN1P04817 590 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SPT3P06844 337 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FUM1P08417 488 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GPA1P08539 472 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HMG2P12684 1045 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PDX1P16451 410 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W STF2P16965 84 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W AMD2P22580 549 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HXT2P23585 541 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W IFM1P25038 676 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BOS1P25385 244 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W IMG1P25626 169 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CIN8P27895 1000 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W BEM3P32873 1128 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W SUI1P32911 108 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NIC96P34077 839 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PCH2P38126 564 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W FHL1P39521 936 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NPT1P39683 429 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NPR2P39923 615 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W VAB2P40003 282 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YER010CP40011 234 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W OSW5P40219 148 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CSM2P40465 213 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W MSS2P40990 351 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W IDS2P46958 469 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NMD5P46970 1048 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W CUL3P53202 744 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YGR127WP53275 312 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RRN9P53437 365 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YNL181WP53878 407 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TGL2P54857 326 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YMR279CQ03263 540 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W WAR1Q03631 944 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YDR179W-AQ03983 463 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W ECM18Q04623 453 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GTO3Q04806 366 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TFC6Q06339 672 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W GSH2Q08220 491 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W TMA16Q08687 178 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W UAF30Q08747 228 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W HFI1Q12060 488 aa3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
VFA1YER128W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CDC8P00572 216 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ARG80P07249 177 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W SSA3P09435 649 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MATALPHA1P0CY06 175 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W HMLALPHA1P0CY07 175 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W MAS1P10507 462 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CDC42P19073 191 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W DAL81P21657 970 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W CNB1P25296 175 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ATG22P25568 528 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W PRR1P28708 518 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W ATP7P30902 174 aa3.33□□□□□ -1.88
VFA1YER128W TFC1P32367 649 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms