RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	INP2	Q03824	705 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ECM11	Q04110	302 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PEX11	Q12462	236 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GAL4	P04386	881 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	CHS1	P08004	1131 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PLB1	P39105	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PCL6	P40038	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YER121W	P40076	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DSE1	P40077	573 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	STB2	P46679	850 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	POL31	P46957	487 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RAD33	Q04231	177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NUT2	Q06213	157 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MDM36	Q06820	579 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	UBP11	P36026	717 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MLH1	P38920	769 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ASK10	P48361	1146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	HER2	Q03557	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DYN3	Q04949	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SFH1	Q06168	426 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	OCA6	Q12454	224 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	UGA1	P17649	471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DUG2	P38149	878 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YHR112C	P38716	378 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ALG5	P40350	334 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PAN6	P40459	309 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	EFM4	P40516	257 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SAE2	P46946	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YAP1802	P53309	568 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NNT1	Q05874	261 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	BSP1	Q06604	576 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AI3	P03877	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RHO2	P06781	192 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	IDP2	P41939	412 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YJL171C	P46992	396 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MFB1	Q04922	465 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	THI73	Q07904	523 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GPM3	Q12326	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	CDC23	P16522	626 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ADH7	P25377	361 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	SLC1	P33333	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	OMA1	P36163	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YHR219W	P38900	624 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	FAA2	P39518	744 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DLS1	P40366	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	FLC3	P53121	802 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ATG10	Q07879	167 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YPR1	Q12458	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MPD2	Q99316	277 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	UNG1	P12887	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MGR1	P25573	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RTC2	P38279	296 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PEX18	P38855	283 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	DIC1	Q06143	298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MRPL8	P22353	238 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	PRO1	P32264	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
DNF2	YDR093W	SER2	P42941	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	NIS1	P53939	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	TVP15	Q03860	143 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	YHM2	Q04013	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	VPS36	Q06696	566 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	STE12	P13574	688 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	IES5	P40060	125 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
DNF2	YDR093W	RMI1	Q02685	241 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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