RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	MGT1	P26188	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	VPH2	P32341	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ARP1	P38696	384 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	TRM5	P38793	499 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ELO1	P39540	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YMR134W	P40207	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LTP1	P40347	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DIA3	P52290	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	EFM6	P53970	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YMR027W	Q04371	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RRI1	Q12468	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SNT1	P25357	1226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YIH1	P25637	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DBF4	P32325	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	UBP8	P50102	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ESBP6	P53918	673 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	CAC2	Q04199	468 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ARP9	Q05123	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	CRC1	Q12289	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	CBS1	P14066	229 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RRT12	P25381	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	KRE2	P27809	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SYN8	P31377	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SLM4	P38247	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SPC97	P38863	823 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YTA12	P40341	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LCL3	P53153	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	BUG1	Q12191	341 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	HKR1	P41809	1802 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MIA40	P36046	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	TSC10	P38342	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	NDT80	P38830	627 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LCB2	P40970	561 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	STB1	P42845	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	FMN1	Q03778	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	URA4	P20051	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	COY1	P34237	679 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DUG2	P38149	878 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	POP4	P38336	279 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SMF2	P38778	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YIL024C	P40543	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	COS5	P47187	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	BIO4	P53630	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	TAF11	Q04226	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RAD10	P06838	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	EXO70	P19658	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	PGS1	P25578	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RAD14	P28519	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SRL3	P36167	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	LEU5	P38702	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DSE1	P40077	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MAM33	P40513	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YGR111W	P53265	400 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ATG17	Q06410	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MSH5	Q12175	901 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	IES3	Q12345	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	DAL2	P25335	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	OCA4	P25366	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	XBP1	P40489	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MRPL19	P53875	158 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	TIM8	P57744	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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